油棕油脂合成调控因子WRI1s的挖掘鉴定及表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 周丽霞
作者: 周丽霞;杨蒙迪;张安妮;曹红星;杨耀东
作者机构:
关键词: 油棕;WRI1s基因;生物信息学;表达分析
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2022 年 003 期
页码:
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: WRI1基因在油棕油脂合成过程中起着重要的调控作用,本研究旨在挖掘油棕WRI1 (EgWRI1)基因,并对其理化性质及组织表达特性进行分析。本研究利用生物信息学方法鉴定获得3个EgWRI1基因,均含有6个内含子,通过染色体定位分析发现EgWRI1-1和EgWRI1-2位于油棕的第5条染色体上,EgWRI1-3位于油棕第10条染色体上。3个基因均含有AP2保守结构域,编码氨基酸数目分别为337 aa、338 aa、367 aa,EgWRI1-1及EgWRI1-3蛋白的等电点均小于7,分别为6.51及6.29,EgWRI1-2蛋白的等电点大于7 (8.31),3个EgWRI1蛋白均为不稳定亲水蛋白,无信号肽,含有多个磷酸化位点,均定位在细胞核中,EgWRI1-1和EgWRI1-3以α-螺旋为主,EgWRI1-2以无规卷曲为主。聚类分析表明在遗传系数为0.625处,3个EgWRI1和ATWRI1同处一个分支,在0.680处,EgWRI1-1和EgWRI1-2的进化关系最近,且与EgWRI1-3聚为一类。定量PCR分析得知EgWRI1-1在中果皮80天时的表达量最大,EgWRI1-2在果仁95天中的表达量最大,在其他组织中表达很低或不表达;EgWRI1-3在各组织中的表达量均较低,该结果为深入研究EgWRI1-1和EgWRI1-2在油棕中果皮和果仁脂肪酸合成过程中的调控机理提供参考。
分类号: S565.9
- 相关文献
[1]油棕WRKY转录因子的全基因组鉴定与分析. 周丽霞,曹红星. 2020
[2]油棕Aux/IAA基因家族鉴定与生物信息学分析. 杨蒙迪,金龙飞,周丽霞,窦雅静,曹红星,李新国. 2021
[3]油棕EgGRF转录因子家族的全基因组鉴定与表达分析. 金龙飞,尹欣幸,曹红星. 2021
[4]油棕等植物γ-生育酚甲基转移酶的生物信息学分析. 石鹏,曹红星,李东霞,王永,雷新涛. 2015
[5]油棕等热带植物DXS基因的生物信息学分析. 石鹏,曹红星,李东霞,王永,雷新涛. 2016
[6]油棕脱落酸受体PYL基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 金龙飞,尹欣幸,曹红星. 2021
[7]油棕脂肪酸外运蛋白基因FAX1的克隆及表达分析. 金龙飞,李睿,曹红星,颜彦. 2022
[8]油棕TCP转录因子家族生物信息学鉴定及基因表达分析. 周丽霞,赵志浩,杨蒙迪,曹红星,杨耀东. 2022
[9]牵牛E3泛素连接酶PNRma1基因的克隆及抗旱相关性分析. 代锦绣,董轩名,倪欢欢,董延龙,金晓霞. 2017
[10]miR-18a-5p在鸡不同生长时期的表达及其生物信息学分析与靶基因预测. 黄正洋,黄华云,穆春宇,李春苗,王钱保,黎寿丰,赵振华. 2021
[11]基于转录组的荔枝GRF基因家族的鉴定及表达分析. 阮城城,胡福初,王祥和,吴凤芝,周文静,吴文碟,周瑞云,陈哲. 2021
[12]大白菜TPS基因家族鉴定及其在高温胁迫下的表达分析. 庞强强,蔡兴来,孙晓东,张文,周曼. 2020
[13]烟草NtMYB44b转录因子基因克隆以及生物信息学和表达分析. 余婧,郭玉双,雷波,张孝廉,赵德刚. 2020
[14]大豆GmGLRs基因全基因组鉴定与表达分析. 崔晓霞,赵硕,郭书巧,束红梅,何晓兰,倪万潮,巩元勇,刘来华. 2019
[15]板栗PPO基因克隆及生物信息学分析. 程丽莉,程运河,兰彦平,曹庆昌,胡广隆,苏淑钗. 2020
[16]罗汉果3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶基因的克隆及表达分析. 荆礼,赵欢,莫长明,苏航,唐秋竹,张鹤. 2020
[17]芒果中性/碱性转化酶MiNI基因的克隆与表达分析. 郭利军,邓会栋,冯学杰,罗志文,陈哲,范鸿雁,胡福初,华敏. 2020
[18]SiASRs家族基因的鉴定及表达分析. 宋健,曹晓宁,王海岗,陈凌,王君杰,刘思辰,乔治军. 2019
[19]番茄WRKY转录因子in silico鉴定及表达分析. 万红建,俞锞,袁伟,刘云飞,叶青静,王荣青,阮美颖,姚祝平,杨悦俭. 2013
[20]大豆胞囊线虫病抗性候选基因GmPEBP4-1克隆及表达分析. 郭杨,陈立新,姜海鹏,战宇航. 2020
作者其他论文 更多>>
-
基于重测序的槟榔InDel标记开发及应用
作者:齐兰;杨耀东;黄丽云;杨玉娟;尹永梅
关键词:槟榔;基因组重测序;InDel标记;遗传多样性
-
油棕果实发育和采后脂肪酸合成转录代谢差异分析
作者:吴秋妃;杨程;张淑岩;韦露;冯美利;李睿;周丽霞;曹红星
关键词:油棕;游离脂肪酸;合成;转录组学;代谢组学
-
基于不同发育时期‘文椰5号’椰子水氨基酸代谢物的测评研究
作者:马雪静;曹红星;高艳明;孙程旭
关键词:椰子;'文椰5号';代谢物;氨基酸;精准测评
-
人工饲料饲育家蚕5龄期的饲料效率研究
作者:王安皆;周丽霞;华丽峰;宋洪燕
关键词:家蚕;人工饲料;饲料效率;体质转化率;茧质成绩
-
椰子CESA基因家族鉴定及生物信息学分析
作者:孙熹微;杨耀东;弓淑芳;王永;肖勇
关键词:椰子(Cocos nucifera L.);CESA基因家族;生物信息学
-
不同油棕品种对干旱胁迫及复水的生理响应及抗旱性评价
作者:周丽霞;杨蒙迪;赵志浩
关键词:油棕(Elaeis guineensis);干旱胁迫;复水;生理指标;抗旱性评价
-
香水椰子香味物质2-乙酰-1-吡咯啉(2AP)的研究进展
作者:孙熹微;周丽霞;李静;弓淑芳;杨耀东
关键词:香水椰子;香味;2-乙酰-1-吡咯啉;代谢通路