含74个腺嘌呤poly(A)尾的猪水泡病病毒HK/70株3′非编码区的克隆及其特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郑海学

作者： 郑海学;刘湘涛;尚佑军;吴锦艳;冯霞;白兴文;田宏;孙世琪;尹双辉;郭建宏;刘在新;谢庆阁

作者机构：

关键词： 猪水泡病病毒;3′NTR;poly(A);二级结构;柯萨奇病毒B5

期刊名称： 中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2006 年 36 卷 01 期

页码： 7-12

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 应用3′RACE法降落式扩增并克隆了猪水泡病病毒(SVDV)HK/70株基因组3′端的真实序列。测序结果表明,所扩增的目的基因片段长4 200 nt,包括非结构蛋白编码区(P2和P3)、3′端非编码区和poly(A)尾,其中3′NTR位于终止密码子TAA之后,长99 nt,poly(A)至少含有74个腺嘌呤碱基。经与参考毒株进行序列比较,结果显示,HK/70株与J1′73、H/3′76和AUG/22/90株的核苷酸同源性较高,为99.0%(仅第65位碱基不同),而与NET/1/92参考毒株的核苷酸同源性较低,为83.3%,与人柯萨奇病毒B5 UK/54株(UK/54-CB5)的同源性为75.7%。同时对3′NTR的二级结构进行分析,并与参考毒株和CB5毒株的二级结构进行了比较。结果表明,它们具有协同变异性,有共同的祖先,显示出3′NTR存在支持其功能所必需的一些结构域。

分类号： S852.65

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