瑟伯氏棉TIR-NBS-LRR类蛋白质编码基因的克隆与分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 杨晓杰

作者: 杨晓杰;赵付安;唐中杰;李武;赵元明;谢德意;房卫平

作者机构:

关键词: 瑟伯氏棉;黄萎病;TIR-NBR-LRR蛋白质编码基因;克隆与分析

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2013 年 29 卷 06 期

页码: 1228-1235

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以对抗黄萎病种质瑟伯氏棉接菌前后高调表达的3个TIR-NBS-LRR类蛋白质点为出发点,根据其对应同源蛋白质B3V7R2(烟草)、B9INW6(棉白杨)和Q19EF1(拟南芥),利用BLAST在线搜索棉花中对应的表达序列标签(EST),分别设计引物,对接菌后的瑟伯氏棉进行RT-PCR扩增,进而以获得的EST序列为母序列,通过电子克隆及RACE技术,克隆了3个编码TIR-NBS-LRR类蛋白质的候选基因。生物信息学分析结果表明,3个候选TIR-NBS-LRR类蛋白质编码基因均具有典型的TIR、NBS及LRR功能域;系统进化分析结果显示,3个候选基因在瑟伯氏棉抗黄萎病机制中可能起重要作用。

分类号: S562

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