黑皮冬瓜NBS类抗病基因同源序列克隆与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵芹

作者： 赵芹;谢大森;何晓明;罗少波;李明珠

作者机构：

关键词： 冬瓜;NBS;抗病同源序列;同源克隆;序列分析

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2014 年 35 卷 10 期

页码： 2071-2077

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以黑皮冬瓜"B98K"种质为试材,根据已克隆的植物NBS类抗病基因保守结构域设计简并引物,PCR扩增冬瓜基因组DNA,获得对应区段的DNA片段,回收克隆与测序后,得到19条抗病同源序列(命名为DNB1至DNB19)。利用DNAStar软件进行序列分析及同源性比对发现,这些抗病同源序列长度在249~252 nt之间,其核苷酸序列同源性在48.4%~98.8%之间,氨基酸序列同源性为23.2%~100.0%,推导氨基酸序列具有P-loop(GGVGKTT)、Kinase-2a(VLDDVW)典型的NBS保守结构域。同源进化分析将其全部归为non TIR-NBS-LRR类,与推导氨基酸序列多重比较结果一致;该序列与其他作物已克隆抗病基因的氨基酸序列同源性在24.7%~99.0%之间。该组序列已登录Genbank,登录号为KF776401~KF776419。

分类号： S642.3

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