我国芝麻主要育成品种遗传多样性分析及优异变异位点挖掘

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李春

作者： 李春;段迎辉;琚铭;苗红梅;杜华;张海洋

作者机构：

关键词： 芝麻;优异等位变异;核苷酸多样性;遗传分化;种质资源;育成品种

期刊名称： 河南农业科学

ISSN： 1004-3268

年卷期： 2022 年 51 卷 003 期

页码： 55-64

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了深入分析芝麻育成品种的多样性,挖掘优异等位基因位点,加快芝麻分子育种进程,以705份芝麻种质资源材料(95份我国育成芝麻品种、405份国内地方种、205份国外种质)基因组数据为基础,开展了芝麻育成品种和地方种间分子多样性的比较分析.通过分析,获得了 12 704个普遍存在的SNP/InDel变异位点,通过比较95份育成品种和405份地方种间的核苷酸多样性差异,发现育成品种的核苷酸多样性指数平均为0.158,较地方种(0.246)显著降低.进一步通过模拟置换检验发现,在95个育成品种中,共有2 483个位点的遗传多样性较地方种显著降低,115个位点的多样性显著升高;同时,以遗传分化系数Fst为参数,筛选出在育成品种与地方种群体之间表现出显著分化的变异位点1 290个.通过结果的交集分析,获得了在群体间显著分化且遗传多样性在育成品种内显著提升的变异位点80个,其中,具有强突变效应的变异位点14个.结合基因组信息分析发现,位点Chr2:8176782和Chr10:3441593分别位于2个抗病相关基因(C_2_2.176和C37.81)内,且在育成品种中的基因频率较地方种分别提高了 12.93倍和3.44倍.上述研究结果表明,某些位点在芝麻育成品种与地方种间发生了显著的多样性变异,而这种改变可能与育成品种优良性状的形成有着密切关系.

分类号： S565.3

  • 相关文献

[1]中国芝麻育成品种的系谱分析. 刘红艳,周芳,赵应忠. 2015

[2]利用高密度基因芯片开展滩羊群体亲缘关系遗传分析. 马丽娜,马青. 2020

[3]贵州芝麻种质资源主要表型性状的遗传多样性. 魏忠芬,杨胜先,李振动,李慧琳,奉斌,林涛. 2016

[4]贵州芝麻种质资源调查、收集及鉴定评价. 魏忠芬,杨胜先,李慧琳,奉斌,林涛,黄泽素,林卫红. 2017

[5]辽宁芝麻种质资源主要农艺性状与产量间的相关分析及通径分析. 那艳斌,孙会杰,高德学. 2015

[6]贵州地方芝麻种质资源品质性状的分析与评价. 杨航,于二汝,魏忠芬,奉斌,李慧琳. 2020

[7]山西芝麻种质资源遗传多样性分析. 吕伟,韩俊梅,任果香,文飞,王若鹏,刘文萍. 2019

[8]辽宁芝麻种质资源形态多样性分析. 那艳斌,孙会杰,高德学. 2018

[9]200份芝麻种质资源农艺性状遗传多样性分析. 韩俊梅,吕伟,任果香,文飞,王若鹏,刘文萍. 2019

[10]河北省芝麻地方品种资源表型多样性分析. 崔彦芹,郭元章,蹇家利,关中波,侯少锋,徐桂真. 2020

[11]新疆芝麻种质资源主要农艺性状的相关性及聚类分析. 崔宏亮,王莉,宋晓晓,姚庆,林啸,西尔娜依·阿布都拉,安万刚,张学超. 2020

[12]芝麻种质资源信息数据库的设计与构建. 杨文娟,高媛,魏鑫,王林海,黎冬华,周瑢,游均,张秀荣,于景印,张艳欣. 2018

[13]芽期Al~(3+)胁迫对芝麻幼苗生长的影响及种质资源耐铝毒性评价. 孙建,乐美旺,饶月亮,颜廷献,颜小文,周红英. 2014

[14]芝麻种质资源叶绿素含量的多样性分析. 孙建,刘红艳,赵应忠,乐美旺,饶月亮,颜廷献,颜小文,周红英. 2009

[15]鄂豫皖芝麻种质资源品质状况分析. 张秀荣,冯祥运,肖唐华. 1993

[16]基于分子标记的江西省芝麻地方种质遗传多样性分析. 王郅琪,孙建,梁俊超,赵云燕,颜廷献,颜小文,危文亮,乐美旺. 2021

[17]江西芝麻种质资源对芽期低温的响应差异研究. 赵云燕,王郅琪,梁俊超,颜廷献,颜小文,乐美旺,危文亮,孙建. 2023

[18]芽期NaCl胁迫下不同基因型芝麻的反应差异研究. 孙建,乐美旺,饶月亮,颜廷献,颜小文,周红英. 2014

[19]芝麻种质资源研究进展与展望. 郑永战,刘艳阳,张海洋,梅鸿献. 2011

[20]芝麻种质资源抗青枯病鉴定. 李信申,饶建辉,肖运萍,魏林根,汪瑞清,黄瑞荣,黄蓉,胡建坤,华菊玲. 2018

作者其他论文 更多>>

微信小程序