基于RAPD标记分析葡萄孢属类似真菌Amphobotrys ricini的遗传多样性
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张蕊
作者: 张蕊;于琳;李国庆;张静
作者机构:
关键词: 葡萄孢属类似真菌;Amphobotrys ricini;RAPD;遗传多样性;UPGMA
期刊名称: 华中农业大学学报
ISSN: 1000-2421
年卷期: 2018 年 05 期
页码: 32-39
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 采用RAPD分子标记对我国15个地区2种寄主植物(铁苋菜和蓖麻)上分离得到的葡萄孢属类似真菌Amphobotrys ricini的81个菌株以及来自美国的1个A.ricini菌株进行了遗传多样性分析。结果显示:筛选出的8条RAPD引物共扩增出63条DNA带,其中有49条DNA条带为多态性条带,多态性条带比率(PPB)为77.8%。多态性信息含量(PIC)值变化范围在0.47~0.84,平均值为0.72,观测等位基因数(Na)的均值为2.000 0、有效等位基因数(Ne)的均值为1.357 7、Nei’s基因多样性指数(H)的均值为0.227 5,Shannon信息指数(I)的均值为0.363 1。UPGMA聚类分析表明,遗传相似系数变化范围在0.55~1.00,以遗传相似系数0.70为阈值时,可分为5个类群(A、B、C、D、E),在遗传相似系数0.74处,B类群又可以分为B1和B2两个亚群。分析结果表明,A.ricini群体内遗传变异与菌株地理来源、寄主植物有一定相关。
分类号: S432.44
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