基于TaqMan探针实时荧光定量PCR检测兰花环斑病毒方法的建立

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙爱青

作者： 孙爱青;王丽花;杨秀梅;许凤;张艺萍;苏艳

作者机构： 云南省农业科学院花卉研究所云南省花卉育种重点实验室国家观赏园艺工程技术研究中心

关键词： 兰花环斑病毒;TaqMan探针;实时荧光定量PCR;兰花

期刊名称： 微生物学通报

ISSN： 0253-2654

年卷期： 2023 年 010 期

页码： 4510-4521

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【背景】兰花环斑病毒（cymbidium ringspot virus, CymRSV）是一类重要的检疫性病毒，在世界范围内危害严重。【目的】建立一种特异性强、灵敏度高且能定量分析CymRSV携带情况的高效检测方法。【方法】通过比对5个CymRSV CP基因序列，利用高度保守区设计3对引物探针并优化筛选后，获得145 bp的靶标序列及对应的最优引物及探针组合。以该靶标序列为模板构建阳性重组质粒，建立标准曲线，并探究其灵敏度、特异性、稳定性和应用效果。【结果】建立的CymRSV实时荧光定量PCR （real-time fluorescence quantitative PCR, RT-qPCR）检测法对阳性质粒标准品的最低检出限可达1 copy，最低稳定检出限达5 copies/μL，是逆转录-聚合酶链式反应（reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR）灵敏度的10~3-10~4倍；标准曲线y=-3.332x+40.371显示，Ct值与拷贝数的对数线性关系良好，扩增效率为99.6%，相关系数R2为0.999；与其他5种常见病毒反应均无扩增曲线，检测特异性强；批组内与批组间重复性试验Ct值变异系数均小于0.6%，重复性和稳定性较好。利用该方法对4类不同种属的20个兰花样品进行检测，阳性对照在Ct为23.31出现扩增曲线，阴性对照及样品未出现扩增曲线。【结论】基于Taq Man探针的CymRSV实时荧光定量PCR检测方法的成功创建，可为开展兰花CymRSV病毒的精准检测与科学防控提供技术支撑。

分类号： S432.41

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