基于BSA-seq技术的青花菜花球蜡质基因初定位及鉴定研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陶美奇

作者： 陶美奇;张振超;潘永飞;孙国胜;许丁帆;山溪;姚悦梅

作者机构：

关键词： 青花菜;蜡质;BSA-seq;初定位;鉴定;候选基因

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2024 年 40 卷 033 期

页码： 131-140

收录情况： CSCD

摘要： 为了发掘调控青花菜花球蜡质合成的相关基因，以青花菜有蜡粉野生型（WT20）为父本，无蜡粉突变体（MT20）为母本构建F2群体，基于F2构建极端有蜡混池和无蜡混池，利用BSA-seq技术对亲本混池和F2极端混池进行混池测序，通过ΔSNP-index算法初步定位与蜡质合成关联的区间，根据基因注释信息预测候选基因，并采用qRT-PCR分析候选基因在亲本中的表达情况。结果表明F2分离群体中有蜡粉株与无蜡粉株分离比为2.87:1，符合单基因隐性核基因遗传规律；两个混池间共获得高质量SNP位点2,045条、InDel位点687条，基于SNP-index关联分析将候选基因定位在4号、7号和8号染色体的3个区间，包含93个基因。进一步对候选区域内的基因进行KEGG、GO、GOC数据库分析发现0.12 Mb和1.07 Mb的区段内92个基因获得注释，对区间内可能跟蜡质合成相关的11个基因进行定量分析，筛选出4个差异显著表达基因BoAPC3、BoCDH1、BoEEF1A和BoAHP4。本研究结果可以为进一步研究青花菜蜡质合成通路提供新思路，以及为选育高品质青花菜奠定基础。

分类号： S634.3

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