转录组测序筛选山羊妊娠早期胚胎附植相关基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 骆金红

作者： 骆金红;陈祥;尚以顺;敖叶;李鹏程

作者机构：

关键词： 努比亚山羊;妊娠早期;子宫角;胚胎附植;转录组测序

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2022 年 53 卷 005 期

页码： 1465-1474

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在通过胚胎附植前、后的山羊子宫角组织高通量测序筛选妊娠早期胚胎附植的关键基因.本研究选取2~4岁体重相近((44.76±3.49)kg)的经产努比亚母山羊16只,在同期发情-人工输精配种后的第15(D15)和第30天(D30)分别随机选取3只羊颈动脉放血处死.采集子宫角组织利用Illumina HiSeq进行高通量转录组测序(RNA-Seq),筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)并对DEGs进行功能注释,基因功能查询进一步筛选与胚胎附植直接相关的调控基因,荧光定量PCR(qRT-PCR)对筛选的基因进行表达量验证分析.D15和D30子宫角组织转录本比较分析发现了 2 000个DEGs,其中上调基因620个,下调基因1 380个.GO功能聚类分析共分为3大类52组,其中细胞组分17组,生物过程23组,分子功能12组,获得细胞连接与增殖,生物粘附与调节,分子活性与转导等重要生物途径.以D15表达量高低为排序标准,从表达量最高的10个基因中筛选出了与胚胎附植有关的基因MGP和TAGLN;从上调和下调幅度最大的前10个差异表达基因中,获得参与妊娠相关糖蛋白合成与分泌的基因PAG-3、PAG-8、PAG-12,参与生长因子结合与生长激素释放激素受体活性相关基因GH-RHR和胰岛素样生长因子结合蛋白基因IGFBP1.qRT-PCR结果显示,随机选取的6个基因在D15和D30子宫角中表达变化趋势与RNA-Seq结果一致.获得的基因MGP、TAGLN、PAG-3、PAG-8、PAG-12、GHRHR、IG-FBP1在努比亚山羊胚胎附植中具有重要作用.

分类号： S827.3

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