基于线粒体16S rRNA基因研究5个栉江珧野生群体的遗传多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 严加坤

作者： 严加坤;杨爱国;周丽青;吴彪;白临建;刘志鸿

作者机构：

关键词： 栉江珧(Atrina pectinta);16S rRNA;遗传多样性

期刊名称： 海洋科学

ISSN： 1000-3096

年卷期： 2013 年 37 卷 02 期

页码： 36-42

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用通用引物对山东长岛、文登、日照、广东湛江和海南三亚等5个地理群体栉江珧(Atrinapectinta)16S rRNA序列进行扩增、测序分析,得到59条441bp的核苷酸序列。其中T、C、A、G和A+T的平均含量分别为29.91%、17.41%、25.74%、26.94%及55.65%,AT含量高于GC含量,共检测到了9个单倍型和26个核苷酸多态位点。群体多样性分析表明,文登群体具有较高的遗传多样性水平。AMOVA分析表明,五群体间总遗传分化系数Fst=0.5007(P<0.001),群体间遗传分化略大于群体内、群体间存在较高的遗传分化。基于群体间遗传距离构建NJ和UPGMA分子进化树,5个地理群体的栉江珧聚为两个支,长岛、文登、日照群体聚为一支,海南和湛江群体聚为另一支。

分类号： S917.4

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