辣椒4CL基因家族成员的鉴定与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 何磊

作者： 何磊;严希;袁圆;余伟;李伟;赖卫;刘崇政;杨红

作者机构：

关键词： 辣椒(Capsicum annuum);4CL基因家族;生物信息学分析;木质素

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 20 卷 008 期

页码： 2478-2484

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 4-香豆酸:辅酶A连接酶(4-coumarate:CoA ligase,4CL)基因家族调控植物木质素代谢、参与类黄酮和其他次生代谢产物合成.为了解辣椒Ca4CL基因家族的分子特性及生物学功能.本研究基于辣椒的全基因组测序结果鉴定4CL基因家族,并进行生物信息学分析.结果共鉴定获得8条辣椒4CL基因,不均匀的分布于基于3、7、11和12号染色体,其中Ca4CL06和Ca4CL08未锚定;辣椒Ca4CL的外显子数目在5~6之间,基序分析结果保守;分析顺式作用元件发现,在辣椒Ca4CLs上游2 000 bp序列中存在多个响应元件,包括光、Me-JA、厌氧诱导、低温等响应元件.辣椒4CL基因家族表达分析发现Ca4CL01在根、茎、叶、果皮(开花期后25 d,绿果期,转色期,转色10 d)、胎座(转色期,转色5 d,转色10 d)中均无表达,其余Ca4CLs表达具有较强组织特异性,Ca4CL04在叶、根、果皮等时期高表达.本研究为进一步分析Ca4CLs基因在生长发育、胁迫等条件下的功能和相应的信号转导途径提供了理论依据.

分类号： S641.3

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