应用DGGE技术分析扇贝养殖海区真核浮游生物种群多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王娜

作者： 王娜;蔡玉勇;李赟;王崇明;崔红

作者机构：

关键词： PCR-DGGE;18S rDNA序列;真核浮游生物多样性

期刊名称： 中国海洋大学学报(自然科学版)

ISSN： 1672-5174

年卷期： 2010 年 40 卷 12 期

页码： 54-59

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为分析扇贝养殖海区真核浮游生物种类和丰度,本研究首先以实验室培养的9种饵料微藻总DNA为模板PCR扩增18S rDNA V1~V3区的高变区序列,筛选用于DGGE分析该扩增序列的变性剂浓度,结果表明,扩增序列长560 bp,DGGE分析可将不同藻种分离开。随后对青岛沙子口扇贝养殖海区9个月份真核浮游生物多样性进行了DGGE分析,结果从9个月份2 m深的海水中总共扩增出38条谱带,其中共有谱带3条,占总数的7.69%,不同月份的特征性谱带11个,占总谱带数的28.2%。不同月份水样中的谱带数显著不同,香农多样性指数为0.4632。相似性分析表明,2009年3和4月养殖海区真核微生物种类相似性最高,为89.7%。基于不同月份水样微生物种类多样性进行UPGMA聚类分析,结果表明,2008年5,6,8月和2009年1,2,3,4月分别聚为一支,显示取样时间相近的月份微生物种类相似度最高。

分类号： S917.1

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