利用EST数据克隆大豆天冬氨酸代谢途径关键酶基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 于妍

作者： 于妍;姜威;唐敬仙;刘春燕;刘迎雪;陈立君;陈庆山;胡国华

作者机构：

关键词： 大豆;天冬氨酸;酶基因;EST数据库

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2009 年 28 卷 04 期

页码： 33-40

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 电子克隆(in silico cloning)是随着基因组计划和EST计划实施而发展起来的利用生物信息学手段进行基因克隆的新方法。本研究根据物种间同源基因相对保守的特点,利用生物信息学方法以不同物种的基因序列为信息探针,运用Blast软件与所下载的大豆EST数据库进行比对拼接,获得基因全长cDNA序列。首次克隆了大豆天冬氨酸代谢途径上AHRI、AHAS、ASADH、BCAT、CBL、DAPD、DAPE、DHDPR、DHAD、HK和TD等11个关键酶基因的cDNA序列。其中AHRI、DAPD、DAPE、DHDPR和DHAD基因经RT-PCR克隆和序列分析验证,长度分别为1764bp、1467bp、1080bp、1035bp和1806bp,结果与电子克隆序列基本一致。本实验通过与不同物种的这些基因蛋白序列比较,发现与双子叶植物拟南芥、蓖麻和马铃薯的同源性较高,而与单子叶植物水稻的同源性略低。

分类号： S565.1`Q943.2

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