构建全基因组导入系所需BC_1F_1群体大小的影响因素分析(英文)
文献类型: 中文期刊
第一作者: 闫龙
作者: 闫龙;刘慧勇;李英慧;张孟臣;邱丽娟
作者机构:
关键词: 导入系;群体大小;模拟
期刊名称: 作物学报
ISSN: 0496-3490
年卷期: 2012 年 38 卷 01 期
页码: 50-54
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 全基因组导入系是遗传和育种研究的重要材料。导入系经受体亲本和供体亲本间连续杂交、回交构建而成,BC1F1群体大小是获得理想导入系群体的关键参数。然而,各物种所需要的最小群体尚不清楚,并且难以通过试验确定。本研究通过编写程序,模拟减数分裂时的重组过程研究适宜的群体大小,并通过数学运算和试验验证程序的可靠性。结果表明,编程模拟与数学计算和试验结果一致。BC1F1群体大小与连锁群数目、连锁群长度和基因密度之间均为正相关。当模拟连锁群从5个增加到40个时,群体大小需要由6.06增加到9.49;当模拟连锁群长度从80cM增加到200cM时,需要的群体大小从7.14增加到8.64;当模拟基因密度从每基因20cM缩小到每基因5cM时,群体大小从7.65增加到8.22。为测试该程序的应用范围,对水稻、小麦、玉米、大豆等主要作物进行了BC1F1群体大小模拟,在保证95%的概率覆盖全基因组条件下,水稻需要的群体最少,为12个个体,小麦和大豆均需13个个体,玉米需要的个体数最多,为14~15个。
分类号: S188
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