新城疫病毒La Sota株F蛋白结构与部分功能区的预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张晓东

作者： 张晓东;刘怀然;刘培欣;闫丽辉;刘胜旺;孔宪刚

作者机构：

关键词： NDV La Sota;F蛋白;结构;B细胞抗原表位;功能

期刊名称： 中国预防兽医学报

ISSN： 1008-0589

年卷期： 2007 年 29 卷 12 期

页码： 938-942

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以新城疫病毒(Newcastlediseace virus,NDV)La sota F蛋白的氨基酸序列为基础,采用Chou-Fasman法、Garnier-Robson法、Karplus-Schulz法与Kyte-Doolittle法、Emini法和Jameson-Wolf法分别预测蛋白质的二级结构和B细胞抗原表位。预测结果表明,NDV La Sota F蛋白结构较为复杂,含有较多的α-螺旋、β-折叠区,转角和无规则卷曲等有柔韧性区域。此外,应用Tmap法预测了NDV La sota F蛋白的跨膜区域,通过同源建模的方法预测了该蛋白的三维空间结构,并比较了强弱毒株裂解位点处空间结构的不同。为进一步通过试验方法确定其蛋白的B细胞表位和从结构出发了解其生物学功能,提供了理论依据。

分类号： S852.65

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