MUC13基因参与的仔猪腹泻调控网络图谱构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 路伏增

作者： 路伏增;褚晓红;戴丽荷;陈绍孟;傅春泉;胡锦平;徐如海

作者机构：

关键词： MUC13;仔猪腹泻;调控网络

期刊名称： 浙江农业学报

ISSN： 1004-1524

年卷期： 2013 年 25 卷 06 期

页码： 1220-1224

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为进一步阐述仔猪腹泻发生的分子机制,应用生物信息学方法构建了MUC13基因参与的仔猪腹泻调控网络图谱,并对其中的基因进行基因功能聚类分析。首先,选择物种为猪,通过STRING数据库分析发现与MUC13相关联的有10种蛋白(MUC4,MUC20,LRCH3,FLJ33471,ACK,ZDHHC19,CTPCT,APOD,Msp,CD71);其次,根据筛选到的蛋白,构建了仔猪腹泻调控网络,并从中找到了MUC13基因参与的仔猪腹泻调控网络,该网络包括MUC13,MUC4,MUC1,MUC2,MUC3,TFF3,NOD1,TNFSF10,FGFR1,CDH2等10个基因;最后,采用DAVID数据库对图谱中的这10个基因进行基因功能注释分析,发现富集相关程度较高的一些基因聚类条目有上皮生长因子(EGF)序列、SEA模块、跨膜结构域、胞质尾区等,因此推测MUC13基因结构的特异性决定了其在仔猪腹泻发展过程中具有特定的功能。文章建立的MUC13基因参与的仔猪腹泻调控网络具有一定的真实性,可以用来描述仔猪腹泻症发生发展过程中分子的相互作用。

分类号： S858.28

  • 相关文献

[1]基于DAP-Seq方法鉴定玉米胚乳特异表达转录因子O2在全基因组水平上的结合位点. 宁丽华,王建晖,时丕彪,伍楚善,董志诚,赵涵. 2019

[2]冷应激后民猪背脂中差异lncRNA的筛选与分析. 马骏杰,汪亮,刘娣,张冬杰,杨秀芹. 2021

[3]小麦盐胁迫响应的代谢组学分析. 姜雪敏,陈向前,李红燕,姜奇彦. 2023

[4]LBD转录因子调控植物生长发育的研究进展. 殷小雨,胡凤荣,杨盼盼. 2024

[5]水稻白叶枯病菌T3SS基因表达及其调控网络. 田芳,何晨阳. 2018

[6]小麦花药发育基因研究进展. 邓中印,廖如意,孙国梁,耿帅锋,李爱丽,毛龙. 2021

[7]多房棘球蚴诱导小鼠枯否氏细胞极化相关ceRNA调控网络的构建与分析. 李艳萍,刘婷丽,李红,陈国梁,王立群,郭小腊,骆学农. 2022

[8]黄单胞菌毒性因子调控的研究进展. 唐庆华,张世清,牛晓庆,朱辉,余凤玉,覃伟权. 2012

[9]油菜籽油脂合成调控基因的分离和鉴定. 华玮,李荣俊,毛晗,刘贵华,王汉中. 2007

[10]四种甘蓝雄性不育类型基因芯片表达谱分析. 康俊根,王晓武,方智远. 2007

[11]Wnt信号通路调控哺乳动物卵泡颗粒细胞生长发育的研究进展. 周祖阳,刘玉芳,储明星. 2023

[12]抑制植物减数分裂重组的分子机理. 李帆,余蓉培,孙丹,王继华,李绅崇,阮继伟,单芹丽,陆平利,汪国鲜. 2019

[13]苏博美利奴羊毛囊发育不同时期ncRNA调控网络的构建. 张小伟,何军敏,徐新明,田月珍,关鸣轩,张漫,付雪峰,哈尼克孜?吐拉甫,黄锡霞,田可川. 2022

[14]非生物胁迫对水稻抽穗期的影响. 孟祥雪,彭永彬,郑崇珂,谢先芝,和亚男. 2023

[15]转录因子网络与植物对环境胁迫的响应. 王计平,史华平,毛雪,李润植. 2006

[16]植物磷饥饿信号分子调控网络及磷高效遗传改良. 张倩倩,任剑豪,张宇昕,郭美娜,易可可,阮文渊. 2024

[17]牧草应对低温胁迫机制研究进展. 廖浩钦,谢文刚. 2023

[18]转录因子Isletl与心脏发育. 邵琼,任家琰,关伟军,马月辉. 2011

[19]转录因子Islet1与心脏发育. 邵琼,任家琰,关伟军,马月辉. 2011

[20]胚胎滞育的研究进展. 韩玉萍,李文,范冰峰,赵向远,许保增. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序