MUC13基因参与的仔猪腹泻调控网络图谱构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 路伏增

作者： 路伏增;褚晓红;戴丽荷;陈绍孟;傅春泉;胡锦平;徐如海

作者机构：

关键词： MUC13;仔猪腹泻;调控网络

期刊名称： 浙江农业学报

ISSN： 1004-1524

年卷期： 2013 年 25 卷 06 期

页码： 1220-1224

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为进一步阐述仔猪腹泻发生的分子机制,应用生物信息学方法构建了MUC13基因参与的仔猪腹泻调控网络图谱,并对其中的基因进行基因功能聚类分析。首先,选择物种为猪,通过STRING数据库分析发现与MUC13相关联的有10种蛋白(MUC4,MUC20,LRCH3,FLJ33471,ACK,ZDHHC19,CTPCT,APOD,Msp,CD71);其次,根据筛选到的蛋白,构建了仔猪腹泻调控网络,并从中找到了MUC13基因参与的仔猪腹泻调控网络,该网络包括MUC13,MUC4,MUC1,MUC2,MUC3,TFF3,NOD1,TNFSF10,FGFR1,CDH2等10个基因;最后,采用DAVID数据库对图谱中的这10个基因进行基因功能注释分析,发现富集相关程度较高的一些基因聚类条目有上皮生长因子(EGF)序列、SEA模块、跨膜结构域、胞质尾区等,因此推测MUC13基因结构的特异性决定了其在仔猪腹泻发展过程中具有特定的功能。文章建立的MUC13基因参与的仔猪腹泻调控网络具有一定的真实性,可以用来描述仔猪腹泻症发生发展过程中分子的相互作用。

分类号： S858.28

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