海洋微生物ZD02信号降解酶基因aiiA克隆及其生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 丁贤

作者： 丁贤;孙威文;张殿昌;翁雄;林黑着;周世宁

作者机构：

关键词： 海洋细菌;群体感应信号降解酶;aiiA基因

期刊名称： 生态学杂志

ISSN： 1000-4890

年卷期： 2013 年 32 卷 08 期

页码： 2056-2061

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据细菌群体感应信号降解酶(AiiA)基因设计简并引物,从海洋微生物ZD02基因组中扩增编码AiiA的基因aiiA,筛选其阳性克隆,测序后分析其基因序列。结果表明:筛选到的阳性克隆ZD02-aiiA序列全长753bp(Genbank登录号:KC756214),存在一个开放阅读框(ORF),编码由250个氨基酸残基组成的多肽,预测分子量为28.1kDa,蛋白等电点为4.78。由该序列推导得到的氨基酸残基序列含有一个保守结构域(Lactamase-B)(34AA～235AA),并预测了AiiA的三级结构。以上研究为该序列的重组表达及其相关活性研究奠定了基础。

分类号： Q933

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