滁州鲫线粒体细胞色素b基因和控制区序列比较及其系统进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 胡玉婷

作者： 胡玉婷;胡王;凌俊;江河;段国庆;潘庭双

作者机构：

关键词： 滁州鲫;细胞色素b;控制区;系统进化分析

期刊名称： 南方水产科学

ISSN： 2095-0780

年卷期： 2015 年 02 期

页码： 101-108

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用PCR产物直接测序法测定了14尾滁州鲫(Carassius auratus gibelio in Chuzhou)的线粒体细胞色素b(Cytochrome b,Cyt b)基因和控制区(D-loop)全序列,长度分别为1 141 bp和924 bp,且均无核苷酸变异位点。Cyt b基因的T、C、A和G含量分别为29.2%、27.8%、28.5%和14.5%;D-loop的T、C、A和G含量分别为33.2%、20.1%、32.6%和14.1%。2种序列中A+T含量(57.7%,65.8%)均明显大于G+C含量(42.3%,34.2%),且G含量偏低,显示了与其他水生动物线粒体核苷酸碱基含量相似的特征。通过对滁州鲫的控制区结构进行分析,识别了其终止序列区(ETAS)、中央保守区(CD)和保守序列区(CSB)的关键序列。滁州鲫与其他鲫属鱼类的Cyt b和D-loop序列均具有高度的相似性,分别为93%~100%和94%~99%。基于2种序列的分子系统进化树分析均表明,滁州鲫与方正鲫(C.auratus gibelio in Fangzheng)亲缘关系最近,而与来自日本的鲫类群亲缘关系最远。

分类号： S917.4

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