猪流行性腹泻病毒山西分离株ORF3基因序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘文俊

作者： 刘文俊;王娟萍;姚敬明;吴忻;孟帆;韩一超;樊振华;薛翼鹏;米瑞娟;李红丽;赵岳

作者机构：

关键词： 猪流行性腹泻;山西分离株;ORF3基因;序列分析

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2017 年 04 期

页码： 103-106

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究山西地区猪流行性腹泻病毒ORF3基因的遗传变异情况,2014-2015年从山西地区11个地市收集的PEDV阳性病料中扩增到4株PEDV的ORF3基因,并进行序列比对及遗传分析。序列分析结果表明,4株PEDV山西分离毒株的ORF3基因与CV777毒株相比,无核苷酸插入和缺失,有部分核苷酸及氨基酸发生变异;4株PEDV山西分离毒株的ORF3基因之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为99.6%~100.0%和98.7%~99.6%,与CV777、疫苗株CV777 truncated和attenuated DR13核苷酸同源性分别为96.6%~97.0%,90.6%,97.6%~98.1%,氨基酸同源性分别为95.1%~96.0%,88.0%,97.1%~98.1%。遗传进化分析结果显示,4株PEDV山西分离毒株与12株2010-2015年我国各地方分离的毒株和2009年分离的CH/JL/09毒株亲缘关系较近;与CV777、LZC、Brl/87和2个疫苗株(CV777truncated和attenuated DR13)亲缘关系较远。

分类号： S852.651

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