水貂TYRP1基因的多态性与毛色性状的相关性分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 刘琳玲

作者: 刘琳玲;岳志刚;涂剑锋

作者机构:

关键词: 水貂;TYRP1基因;毛色;多态性;相关性分析

期刊名称: 黑龙江畜牧兽医

ISSN: 1004-7034

年卷期: 2023 年 16 期

页码: 129-133+140

收录情况: 北大核心

摘要: 为了研究水貂TYRP1基因多态性与毛色性状的相关性,试验首先提取384只水貂的血液基因组DNA,然后对水貂TYRP1基因外显子2,3,4进行PCR扩增并测序,通过序列比对识别单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点并进行基因分型,统计SNP位点在不同品种水貂群体(红眼白水貂、银蓝水貂、短毛黑水貂和咖啡水貂)中的基因型频率和等位基因频率后进行遗传多样性分析,最后采用卡方(χ~2)检验对SNP位点基因型与毛色性状进行相关性分析。结果表明:TYRP1基因外显子3,4未识别到SNP位点,而外显子2识别到1个SNP位点(C777G位点),C777G位点在4个品种水貂群体中共存在3种基因型(CC型、CG型和GG型)。红眼白水貂群体的优势基因型为GG型,优势等位基因为G;银蓝水貂、短毛黑水貂和咖啡水貂群体的优势基因型均为CC型,优势等位基因均为C,其中短毛黑水貂群体的基因型全部为CC型,等位基因全部为C。C777G位点在红眼白貂和银蓝水貂群体中极显著偏离哈代-温格平衡状态(P<0.01),在咖啡水貂群体中处于哈代-温格平衡状态(P>0.05)。红眼白、银蓝和咖啡三个品种水貂TYRP1基因C777G位点为轻度多态(PIC<0.25),短毛黑水貂TYRP1基因C777G位点无多态性(PIC=0)。4个品种水貂TYRP1基因C777G位点的纯合度(Ho)在0.695 7(咖啡黑水貂)~1.000 0(短毛水貂)之间,杂合度(He)在0(短毛黑水貂)~0.304 3(咖啡水貂)之间,有效等位基因(Ne)在1.000 0(短毛黑水貂)~1.347 8(咖啡水貂)之间。C777G位点基因型与红眼白、银蓝和咖啡三个品种水貂毛色性状极显著相关(P<0.01)。说明TYRP1基因C777G位点可作为水貂毛色性状辅助选择的分子标记。

分类号: S865.22

  • 相关文献

[1]水貂TYR基因T138A位点多态性及其与毛色性状的关联分析. 宋兴超,徐超,刘宗岳,杨童奥,岳志刚,刘琳玲,丛波,杨福合. 2017

[2]美洲水貂TYR 基因变异与毛色相关性分析. 邢思远,杨童奥,郭强,杨福合. 2015

[3]美洲水貂TYR基因变异与毛色相关性分析. 邢思远,杨童奥,郭强,杨福合. 2014

[4]美洲水貂TYR基因变异与毛色相关性分析. 邢思远,杨童奥,郭强,杨福合. 2015

[5]獭兔MITF基因部分外显子多态性研究. 牛晓艳,任克良,曹亮,李燕平,郑建婷,黄淑芳,唐耀平. 2013

[6]獭兔MITF基因部分外显子多态性研究. 牛晓艳,任克良,曹亮,李燕平,郑建婷,黄淑芳,唐耀平. 2013

[7]BMP15基因多态性对百宜黑鸡繁殖性能的影响. 粟朝芝,吴松成,韩雪,朱丽莉,陶宇航,陈林,伍革民. 2020

[8]西藏绒山羊KAP13.1基因的多态性及其与生产性状的关联分析. 吴玉江,索朗达,巴贵,次仁德吉,德吉,宋天增,益西多吉,巴桑玉珍,达瓦,旦增扎巴,边巴次仁,边巴卓玛,次仁央吉,云丹罗布,袁超. 2018

[9]黑貉TYRP1基因的克隆及生物信息学分析. 郭跃跃,张宇飞,王天骄,邢秀梅,徐超,赵家平. 2019

[10]畜禽羽色候选基因ASIP和TYRP1的研究进展. 张静,刘毅,刘安芳. 2015

[11]滩羊裘皮毛色调控基因的研究进展. 王晓薇,马青,马丽娜,王锦,赵正伟. 2019

[12]滩羊毛色的全基因组关联分析. 王晓薇,马青. 2020

[13]MicroRNA调控动物毛囊生长发育及毛色的研究进展. 葛桂华,谭娅,杨琼,杨大洪,蒲红州,张顺华,朱砺. 2017

[14]不同毛色中国美利奴羊毛纤维细度与黑色素含量分析. 余刚,司小花,沈思军,郭延华,张宾,代蓉. 2019

[15]滩羊毛色候选基因MC1R和TCF25的mRNA表达量定量分析. 王晓薇,樊毅,马小明,马丽娜,岳彩娟,王锦,赵正伟,马青. 2020

[16]长白猪、枫泾猪和它们的杂种后代Ag-NOR的研究. 于汝梁,辛彩云,陈琳,方樟明,陈隆. 1992

[17]定安猪保种及改良现状调查. 宋延霞,倪世恒,王峰,何帅涵,王余北,董柠其,方美英. 2023

[18]波尔山羊与麻城黑山羊杂交后代的毛色表观分析. 李晓锋,张年,索效军,熊琪,杨前平,陈明新. 2012

[19]利用转录组测序方法研究獭兔毛色相关基因. 牛晓艳,任克良,曹亮,李燕平,郑建婷,冯国亮,黄淑芳. 2016

[20]藏羊刺鼠信号蛋白基因(Agouti)的多态性及不同颜色被毛皮肤组织中Agouti与小眼畸形相关转录因子基因(MITF)表达的定量分析. 韩吉龙,岳耀敬,裴杰,郭婷婷,刘建斌,郭健,孙晓萍,冯瑞林,杨博辉. 2013

作者其他论文 更多>>