草鱼EST-SSRs标记的筛选及其与生长性状相关分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王解香

作者： 王解香;白俊杰;于凌云

作者机构：

关键词： 草鱼;EST-SSR;生长性状;关联分析;遗传多样性

期刊名称： 淡水渔业

ISSN： 1000-6907

年卷期： 2012 年 42 卷 01 期

页码： 3-8+29

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用草鱼(Ctenopharyngodon idella)EST(expressed sequence tags)数据库开发的18个EST-SSR标记,对草鱼群体进行基因型与生长性状关联分析和群体遗传多样性分析,结果表明:关联分析得到6个微卫星位点(13118、13305、24017、25085、35939和40698)与体重,体长和体高显著或极显著相关(P<0.05或P<0.01)。对其进行多重比较获得有利基因型分别为13118位点的BB、13305位点的AD、24017位点的AC、25085位点的BE、35939位点的BB和40698位点的BB。将6个微卫星位点上的EST序列与GenBank数据库进行BLAST比对,其中24017序列与鲤鱼自然杀伤细胞增强因子(NCEF)同源性水平高达86%,25085序列与草鱼反应元件结合蛋白(CREB)的基因同源性水平达到80%。应用这18个微卫星位点对草鱼养殖群体进行遗传多样性分析,共检测到82个等位基因,平均等位基因4.556个,每个位点检测到的等位基因数为2～9个,群体的平均观测杂合度为0.452 9,平均期望杂合度和平均多态信息含量分别为0.457 1和0.401 7,表明该群体遗传多样性处于低水平。

分类号： S917.4

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