烟草基因组中AGO蛋白的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 蔡健宇

作者： 蔡健宇;武晓云;郭玉双;李翔宇

作者机构：

关键词： 生物信息学;烟草;Argonaute(AGO);分子结构;功能预测

期刊名称： 江西农业学报

ISSN： 1001-8581

年卷期： 2017 年 29 卷 02 期

页码： 1-8

摘要： 对在NCBI上登录的烟草AGO蛋白(argonaute proteins)的信息进行了整理,并对其组成成分、系统发育树、信号肽、跨膜结构域、细胞定位、亲水性/疏水性、蛋白质的二/三级结构等进行了预测和分析。结果表明:在烟草基因组中共有22个AGO蛋白,可分为8类;烟草的AGO蛋白与拟南芥的AGO一样在进化上分为3个分支,其编码的蛋白是一个无跨膜结构域、无信号肽/导肽的亲水性蛋白,α-螺旋散布于整个蛋白质中,具有PAZ和PIWI两个特征结构域。此外,烟草的AGO2/4/7/16/PNH1定位在细胞核中,AGO10定位在细胞质中,AGO5定位在线粒体中。

分类号： Q943.2

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