鸡基因组pre-microRNA SNP多态性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 耿立英

作者： 耿立英;张传生;杜立新

作者机构：

关键词： 小RNA;生物信息学;单核苷酸多态

期刊名称： 生物多样性

ISSN： 1005-0094

年卷期： 2009 年 17 卷 03 期

页码： 248-256

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探讨鸡pre-microRNA SNP的多态性及其可能的功能意义,对鸡471个pre-microRNA区域的SNP位点进行了鉴定和生物信息学分析。结果表明:pre-microRNA的SNP多态性显著地低于其侧翼区(P<0.01=,其种子区SNP变异对pre-microRNA二级结构稳定性的影响高于其他各区;microRNA成熟体SNP可能影响microRNA对靶基因的选择。研究结果提示:pre-microRNA相对于其侧翼区在分子进化过程中受到更大的选择压力;成熟体SNP可通过影响microRNA加工和靶基因的选择,改变多种生理过程,导致鸡种间表型变异。研究结果将为鸡microRNA的进化模式研究及其功能性SNP的鉴定提供参考信息。

分类号： S831

  • 相关文献

[1]鸡基因组pre-microRNASNP多态性. 耿立英,张传生,杜立新. 2009

[2]利用生物信息学方法预测家蚕核型多角体病毒基因组编码的miRNA. 陈蔚,黄勇,赵巧玲,宋菲,裘智勇. 2011

[3]鸡6个功能基因microRNA靶标区域SNP的生物信息学预测. 耿立英,张传生,杜立新. 2008

[4]核受体辅激活蛋白1基因(NCOA1)作为鸡产蛋性状候选基因的研究. 黎寿丰,赵振华,黄华云,张静,丁余荣. 2010

[5]中国美利奴羊多胎品系选育中多胎性状分离与BMPR-IB基因型的相关性分析. 杨华,张永胜,何其宏,王建华,杨永林,钟发刚,王新华,刘守仁. 2009

[6]母猪FcRn基因多态性及其对初乳中IgG含量的影响. 王炳艳,王立贤,王婷,翟丽维,王楚端,李振宽,周伟良. 2007

[7]基于重测序的大豆新品种齐黄34的全基因组变异挖掘. 张彦威,李伟,张礼凤,王彩洁,戴海英,徐冉. 2016

[8]猪RBP1和RBP4基因的定位、组织表达谱和多态性. 公维华,唐中林,崔文涛,杨述林,李奎. 2007

[9]三倍体香蕉优良品种‘Grand Nain’全基因组变异挖掘. 邵秀红,胡春华,盛鸥,毕方铖,邓贵明,杨乔松,易干军. 2018

[10]绵羊产羔性状主效基因检测研究. 王启贵,钟发刚,李辉,王新华,刘守仁,陈晓军,甘尚泉. 2005

[11]扩增子测序结合高分辨率溶解曲线鉴定花生单核苷酸多态. 刘颖,朱方何,洪彦彬,刘洪. 2015

[12]绵羊BMPR-IB基因多态性与其产羔数的相关研究. 王启贵,钟发刚,李辉,王新华,刘守仁,陈晓军. 2003

[13]NPY基因SNPs与鸡屠体性状的关联分析. 周卫东,杨菲菲,宋雪梅,姜俊芳,邵涛. 2009

[14]鸡mir-1644基因“seed”区的T>C多态分析. 耿立英,张传生,尹春光,曹顶国,杜立新,陈娟. 2011

[15]鸡microRNA基因“seed”区4个SNPs的群体遗传分布. 耿立英,张传生,尹春光,曹顶国,付志新. 2011

[16]苏尼特羊拷贝数变异的基因组分布特征研究. 刘佳森,张莉,李蕴华,赵福平,魏彩虹,杜立新. 2013

[17]ESR、NPY基因对文昌鸡繁殖性状的遗传效应分析. 于吉英,陈宽维,肖小君,李慧芳,朱文奇. 2008

[18]猪RBP2和CRABP2基因的定位、组织表达谱分析、单核苷酸多态性研究及其关联分析. 公维华,唐中林,杨述林,崔文涛,李奎. 2007

[19]抗病毒RNA沉默和病毒拮抗RNA沉默策略研究进展. 施艳,韩卫丽,孙虎,王振跃. 2012

[20]植物与线虫互作的信号传导及调控机制研究进展. 叶德友,漆永红,李敏权. 2016

作者其他论文 更多>>

微信小程序