新疆断裂带含硫冷泉泉水细菌群落结构多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李慧

作者： 李慧;曾军;高小其;杨红梅;张涛;杨晓芳;孙建;娄恺

作者机构：

关键词： 新疆断裂带;含硫冷泉;细菌多样性;16SrRNA基因文库;系统发育树

期刊名称： 微生物学报

ISSN： 0001-6209

年卷期： 2011 年 51 卷 05 期

页码： 595-602

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】为了解新疆断裂带含硫冷泉泉水中细菌群落结构的组成和物种多样性。【方法】采用免培养法直接从冷泉水中提取环境总DNA,采用细菌通用引物对泉水中细菌的16S rRNA基因进行PCR扩增,构建16S rRNA基因克隆文库。使用限制性内切酶HaeⅢ对随机挑选的阳性克隆子进行限制性片段长度多态性分析(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP),选出具有不同酶切图谱的序列进行测序、BLAST比对和构建16S rRNA基因系统发育树。【结果】共从细菌16S rRNA基因文库中筛选了228个阳性克隆,RFLP分型得到33个不同的操作分类单元(Operational Taxonomic Unites,OTUs),覆盖度(Coverage C)为92%。BLAST比对、RDP归类及系统发育分析将这33个OTUs归为:变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)。变形菌门为绝对优势类群,占整个细菌克隆文库的98%,其中20%左右的类群与硫化物代谢相关的光合自养和化能自养类群纯培养菌具有高的相似性(>97%)。此外,还发现大量类群(总文库的64%,其中57%为军团菌属Legionella spp.,类群)与GenBank中已存细菌16SrRNA基因相似性小于96%。【结论】新疆断裂带含硫冷泉泉水中细菌类群的多样性较低,但可能存在大量潜在细菌新种和新分类。另外,该泉水可能是潜在的新军团菌病传播源,因而可能对下游人畜健康存在潜在威胁。

分类号： Q938.8

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