菊芋实时定量PCR分析中内参基因的选择

文献类型： 中文期刊

第一作者： 宋向阳

作者： 宋向阳;杨世鹏;钟启文;王丽慧;赵孟良;李莉;孙雪梅

作者机构： 青海大学农林科学院青海省蔬菜遗传与生理重点实验室;青海大学三江源生态和高原农牧业国家重点实验室;;青海大学农林科学院青海省蔬菜遗传与生理重点实验室;青海大学三江源生态和高原农牧业国家重点实验室;;青海大学农林科学院青海省蔬菜遗传与生理重点实验室;青海大学三江源生态和高原农牧业国家重点实验室;

关键词： 菊芋;实时荧光定量PCR;内参基因

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 1190-1196

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 实时荧光定量PCR具有灵敏度、特异性和重复性好等优点,是植物中常用于基因表达和转录分析的重要手段。在分子生物学的研究中,选择表达相对稳定的内参基因是分析实时荧光定量实验数据的前提。本研究以菊芋(Helianthus tuberosus)开花时期的幼根、嫩茎、叶片、块茎和花瓣为材料,运用荧光定量PCR方法分析了18S rRNA、EF1α、Actin、β-actin、GAPDH、25S rRNA和UBQ5 7个内参基因的表达量,通过Ge Norm、Norm Finder和Best Kkeeper软件的综合分析,发现25S r RNA的稳定性最好,可用于菊芋基因表达的内参基因。而GAPDH在不同样品中稳定性最差,不适合作为内参基因。本研究为菊芋实时荧光定量PCR中内参基因的选择提供了参考。

分类号： S632.9

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