沙蓬全基因组Survey测序分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨文静

作者： 杨文静;张丽;甘晓燕;聂峰杰;巩檑;刘璇;宋玉霞

作者机构：

关键词： 沙蓬(Agriophyllum squarrosum);基因组;Survey测序

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2025 年 23 卷 003 期

页码： 894-898

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 沙蓬作为流动沙丘上的先锋植物群落，种子蛋白质含量高，具有重要的生态经济意义，对其基因组的研究有助于深入开展分子遗传学研究，并为绘制全基因组精细图谱提供依据。本研究运用二代高通量测序技术，获得137.75 Gb有效数据，总测序深度为89×，以K=17进行K-mer分析并修正后，拟南芥的基因组估计为1.02 Gb、杂合率为0.49%、70.18%和38.46%，属微杂合高度重复的基因组。经初步组装，获得了1 569 bp、605.2 Mb的ContigN50和3 453 bp、644.4 Mb的ScaffoldN50。本研究将在国际上率先对沙蓬属植物进行全面的基因组学分析，并在此基础上对其进行深入的基因组学分析。

分类号： Q943.2

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