水牛NOBOX基因启动子克隆及转录活性检测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陆杏蓉

作者： 陆杏蓉;庞春英;朱鹏;邓廷贤;段安琴;陈明棠;杨炳壮;梁贤威

作者机构：

关键词： 水牛;新生儿卵巢同源盒基因(NOBOX基因);克隆;生物信息学分析;转录活性

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2016 年 03 期

页码： 196-200+265-266

收录情况： 北大核心

摘要： 为了对广西本地水牛新生儿卵巢同源盒基因(NOBOX基因)5'侧翼序列进行克隆、生物信息学分析及其转录活性进行研究,试验采用Gen Bank上已公布的黄牛NOBOX基因5'侧翼序列设计引物,以广西本地水牛血液基因组为模板扩增NOBOX基因5'侧翼序列并进行生物信息学分析。结果表明:研究成功克隆得到广西本地沼泽型水牛NOBOX基因5'侧翼序列及部分CDS区序列,共2 906 bp。同源性分析结果表明,其与地中海水牛、黄牛、绵羊和山羊的相似性分别为99%、96%、91%、91%。试验对NOBOX基因5'侧翼序列2 000 bp进行启动子及转录因子结合位点预测,在其翻译起始位点上游-868/-853 bp处存在TATA box,启动子区存在GATAs、Foxo1、Foxo3、Nobox、Stat1、Stat3、Stat4、Stat5a、Stat5b、Stat6、YY1等反式作用元件结合位点,其中GATAs家族基因在NOBOX启动子区存在多个结合位点,且同一位点又存在多个GATA基因结合。水牛NOBOX启动子能够启动EGFP在HEK-293T细胞上表达,但表达非常微弱,也能够启动EGFP在CHO细胞上表达,且与CMV启动EGFP在CHO细胞中的表达强度相似,表明水牛NOBOX是个强启动子。

分类号： S823.83

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