文心兰EST-SSR标记的开发及其在遗传多样性分析中的应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 林榕燕

作者： 林榕燕;钟淮钦;黄敏玲;罗远华

作者机构：

关键词： 文心兰;EST-SSR;多态性;遗传多样性

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2016 年 14 卷 11 期

页码： 3113-3119

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究基于NCBI数据库中文心兰的EST序列,对其EST-SSR标记进行分析,并设计了20对EST-SSR引物用于30个文心兰品种遗传多样性性分析研究。对3 183条文心兰EST序列进行搜索,共检索出274个SSR位点,检出率为8.61%。二核苷酸重复类型是文心兰EST-SSR的主要重复类型,占60.58%。通过PCR扩增检测到13对引物有扩增产物,其中10对引物有多态性,平均每对引物扩增到10个多态性条带,各引物的多态性比率分布为75.00%~100.00%,多态性信息含量变化范围为0.69~0.93。聚类分析发现30个文心兰品种间的遗传距离变化在0.04~0.58,且在遗传距离为0.39处可将30个文心兰品种分为7大聚类群。

分类号： S682.31

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