鸭胚胎发育后期胸肌萎缩相关通路及基因鉴定

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘宏祥

作者： 刘宏祥;朱春红;宋卫涛;陶志云;徐文娟;章双杰;王志成;李慧芳

作者机构：

关键词： 鸭;胚胎;胸肌;WGCNA;GSEA

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2023 年 022 期

页码： 190-199

收录情况： 北大核心

摘要： 与哺乳动物不同，禽类胚胎在卵中发育，在胚胎后期表现为胸肌萎缩，为探明其涉及的分子机制，探索高邮鸭和金定鸭在孵化后18胚龄（ed）至出雏后7日龄（d）的胸肌发育规律，在21 ed、27 ed和5 d 3个时间点采集胸肌样品进行转录组测序（RNA-seq）。采用加权基因共表达网络分析（WGCNA）,以及基于KEGG数据库的过表征（ORA-KEGG）和基因集富集分析（GSEA-KEGG）2种功能富集分析方法，鉴定与27 ed胸肌萎缩特征相关的信号通路及相关基因；最后通过实时荧光定量PCR（qRT-PCR）方法验证WGCNA得到的棕色模块中核心基因的表达水平。高邮鸭和金定鸭的胸肌质量均从18 ed到24 ed迅速增加，24 ed开始到1 d逐渐下降，1 d后继续增加。通过WGCNA得到的7个共表达模块中棕色模块与27 ed的相关性最高(r=0.98,P=2×10-12),该模块内的基因通过ORA-KEGG方法富集到了氧化磷酸化和柠檬酸循环2条能量代谢相关的信号通路。通过GSE-KEGG方法对所有转录表达的基因功能富集，挖掘到了自噬相关的信号通路。qRT-PCR验证的棕色模块内基因中，自噬通路中的突触体相关蛋白29（SNAP29）和蛋白激酶AMP激活的催化亚基α2（PRKAA2）基因在27 ed时表达量显著增加（P＜0.05）。在胚胎后期，鸭胸肌出现发育停滞甚至萎缩，这可能是胸肌动员降解以释放能量从而应对能量紧张状态的结果。在这一过程中，能量传感器AMPK的激活和自噬途径中SNAP29等关键基因表达的升高可能是胸肌蛋白质降解途径激活的原因。

分类号： S834

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