赤芝全基因组SSR位点的筛选及种质资源遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐晓兰

作者： 徐晓兰;陈体强;兰进;陈向东;朱风丽;陈虎;石林春;陈士林

作者机构：

关键词： 赤芝;基因组;SSR标记;多态性;种质资源;遗传多样性;聚类分析;育种

期刊名称： 世界中医药

ISSN： 1673-7202

年卷期： 2020 年 05 期

页码： 677-682

摘要： 目的:基于赤芝全基因组序列开发SSR标记,研究其种质资源遗传多样性,为赤芝种质资源品种鉴定和分子育种提供理论基础。方法:利用60对SSR引物,对26份不同来源的赤芝菌株进行扩增以筛选出具有多态性的位点;采用毛细管电泳对其进行基因分型,并分析菌株间的遗传多样性。结果:60对引物中,筛选出24个有多态性条带的SSR位点。共扩增出269个多态性条带,平均每个SSR位点增出11.20个多态性条带;检测出150个等位基因,平均检测出6.23种基因型;各引物的多态信息含量(PIC)为0.57～0.91,平均为0.81;遗传一致性和遗传距离变异范围分别为0.28～0.95和0.06～0.73;聚类分析结果分析可以很好的反映出各个菌株间的亲缘关系,在遗传距离系数0.17处可分为4大类,部分来自同一地区的菌株材料分散于各个分支,未体现明显地域性,说明菌株的遗传背景复杂,多态性高。结论:筛选出的24个赤芝SSR位点,可以用于赤芝菌株资源遗传多样性分析,为赤芝优良品种的引种及选育提供理论基础。

分类号： S567.3

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