金针菇基因组SSR位点分析及标记开发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 金群力

作者： 金群力;沈颖越;蔡为明;周烁红;范丽军;冯伟林;宋婷婷;李良英;田芳芳

作者机构：

关键词： 金针菇基因组;SSR位点;多态性标记

期刊名称： 食用菌学报

ISSN： 1005-9873

年卷期： 2016 年 23 卷 02 期

页码： 12-19

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以金针菇(Flammulina velutipes)基因组序列为基础,对其SSR位点进行分析,设计16对引物对其中16个SSR位点进行标记设计,并对6个商业化的金针菇品种进行筛选。统计结果表明,金针菇基因组有1279个位点,SSR位点密度为35.53/Mb,并以三核苷酸基序为主,重复数≥10的SSR(即高频)基序数目总计246个,占所有SSR位点的19.23%。设计的16对SSR标记均能扩增条带,多态率仅为18.75%。

分类号： S646.15

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