水牛LGALS3BP基因克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 朱鹏

作者： 朱鹏;庞春英;段安琴;邓廷贤;陆杏蓉;梁贤威

作者机构：

关键词： 水牛;LGALS3BP;克隆分析

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2016 年 03 期

页码： 535-541

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了阐明水牛半乳糖凝集素3结合蛋白(lectin,galactoside-binding,soluble,3 binding protein,LGALS3BP)基因的结构及功能,本试验采用了3'RACE克隆获得LGALS3BP基因并对其进行了信息学分析。结果表明:水牛LGALS3BP基因编码区长1 668 bp,3'UTR区长590 bp,编码555个氨基酸。BLAST程序比对结果表明克隆获得的LGALS3BP序列与人、非洲象、猫、马、猪、绵羊和牛的同源性分别为82%、82%、84%、83%、94%、94%和97%,系统进化树分析结果表明,LGALS3BP基因在不同物种以及进化的过程中具有高度保守性。蛋白质分析结果表明LGALS3BP蛋白呈弱酸性,第18~19位氨基酸为其蛋白信号肽剪切区域,亚定位于细胞外,存在SR,BACK和BTB等结构域。micro RNA预测显示bta-mi R-2316,bta-mi R-484和btami R-2888等可能为LGALS3BP 3'非翻译区(untranslated region,UTR)潜在靶标。总之,本研究成功克隆获得了水牛LGALS3BP基因并对其进行了系统的信息学分析。

分类号： S823.83

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