掌叶覆盆子染色体计数及基因组大小测定

文献类型： 中文期刊

第一作者： 金亮

作者： 金亮;李春楠;詹书侠;李小白;华金渭

作者机构：

关键词： 掌叶覆盆子;染色体数目;基因组大小;流式细胞术;K-mer分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 20 卷 018 期

页码： 6009-6014

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 掌叶覆盆子(Rubus chingii Hu)是重要的药用植物,由于基因组数据缺乏,导致其分子生物学研究进展相对缓慢.本研究采用根尖染色体制片技术来确定其倍性;利用流式细胞术和K-mer分析方法对其基因组大小进行了测定.结果如下,掌叶覆盆子根尖染色体数目为2n=2x=14;采用流式细胞术,以萝卜'Saxa'为内标测定的掌叶覆盆子基因组大小为(255.39±7.58)Mb;K-mer分析估测的掌叶覆盆子基因组大小为262.2 Mb,杂合率为0.91%,重复序列比例为42.54%;根据各分析指标,推测该掌叶覆盆子基因组为一般复杂基因组.本研究结果将为掌叶覆盆子的全基因组测序研究提供重要参考.

分类号： S567.19

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