草原红牛FABP7基因克隆、生物信息学及组织表达差异分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吕阳

作者： 吕阳;曹阳;高一;刘理想;薛佳佳;张国梁

作者机构：

关键词： 草原红牛;FABP7基因;生物信息学;表达差异;脂质代谢

期刊名称： 中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2019 年 009 期

页码： 48-52,57

收录情况： 北大核心

摘要： 本研究旨在克隆草原红牛脂肪酸结合蛋白7基因(FABP7)的CDS区序列并对其进行生物信息学分析,同时检测其在牛各个组织中的mRNA表达水平.利用RT-PCR技术克隆草原红牛FABP7基因CDS区序列,并使用多种生物软件和在线工具进行生物信息学分析,通过qPCR技术检测FABP7基因在各组织间mRNA的表达水平.结果表明:草原红牛FABP7基因CDS区全长399 bp,编码132个氨基酸,蛋白分子量为14.96 ku,理论等电点为5.38,属于亲水性蛋白;通过NCBI-BLAST对比发现,草原红牛与普通牛、羊、猪、人、鼠、鸡的核苷酸序列同源性分别为99%、98%、94%、92%、85%、85%,系统进化树结果发现,草原红牛与普通牛亲缘关系最近,与鸡的亲缘关系最远;FABP7蛋白序列有1个二硫键,14个磷酸化位点,1个N-糖基化位点,不存在信号肽和跨膜区;在蛋白的二级结构和三级结构中发现,FABP7蛋白主要存在2个α-螺旋结构和10条β-折叠,为混合型蛋白.FABP7基因在小肠组织表达量最高,在心脏、脂肪和胃中中度表达.

分类号： S823

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