玉米RIL群体SNP偏分离分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 付忠军

作者: 付忠军;官玲;张丕辉;董昕;李淑君;陈荣丽;祁志云;杨华

作者机构:

关键词: 玉米;偏分离;SNP;重组自交系(RIL)

期刊名称: 农业生物技术学报

ISSN: 1674-7968

年卷期: 2019 年 09 期

页码: 1542-1549

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 偏分离是自然界普遍存在的现象,是生物进化的重要动力。随着分子标记技术的发展进步,不同作物的遗传研究中报道了大量偏分离现象,偏分离的比例和遗传效应因物种、群体、标记类型等的不同而变化,并存在偏分离热点区域。为探讨玉米(Zea mays)偏分离现象及其产生原因,本研究以热带玉米自交系B31-3与温带玉米自交系HZ4杂交得到的F_8代重组自交系(recombinant inbred lines, RIL)群体为材料,共198份株系,采用MaizeSNP3072芯片对该重组自交系群体进行基因型分析,获得747个在双亲间有多态性的SNP数据,通过偏分离分析发现,有279个SNP标记发生偏分离(P<0.05),占总标记数的37.3%。其中,偏向母本B31-3的SNP有194个,占偏分离SNP的69.5%;偏向父本HZ4的SNP有85个,占偏分离SNP的30.5%。在玉米6条染色体上共发现10个偏分离热点区域。10个偏分离热点区域(segregation distortion regions, SDRs)中仅有3个偏向父本HZ4,另外7个全部偏向母本B31-3。这些偏分离的发生及偏分离热点区域的形成可能与配子体选择及高温环境有关。本研究为探究玉米偏分离规律提供了基础资料。

分类号: S513

  • 相关文献

[1]玉米生物诱导孤雌生殖DH群体的SNP偏分离分析. 许理文,段民孝,宋伟,田红丽,王凤格. 2015

[2]小麦SSR和SNP标记在Taichung29×白芒麦重组自交系群体中的偏分离分析. 郭继元,王凤涛,蔺瑞明,冯晶,张忠军,徐世昌. 2018

[3]野生大豆*栽培大豆RIL群体高密度遗传图谱构建及SNP偏分离分析. 刘德泉,聂波涛,邱红梅,陈亮,陈健,崔正果,姬文秀,王跃强. 2023

[4]玉米GY220×1145组合RIL群体粗缩病抗性性状的遗传分析. 石明亮,陆虎华,薛林,徐辰武,黄小兰,胡加如,陈国清,程玉静,陈小晖,孙权星,彭长俊. 2012

[5]玉米不同回交世代DH系遗传分析研究. 齐欣,刘欣芳,马骏,贾钰莹,刘晓丽,孟庆国,姜敏,李思南. 2020

[6]玉米RIL群体SSR分子标记偏分离的遗传分析. 周汝平,李淑君,杨华,祁志云,董昕,付忠军. 2017

[7]玉米RIL群体SSR分子标记偏分离的遗传分析(英文). 付忠军,李淑君,杨华,董昕,祁志云. 2017

[8]SNP分子标记在玉米非生物逆境抗性上的研究进展. 于滔,曹士亮,张建国,王明泉,王成波,武尓娜,刘宝民,曹靖生. 2019

[9]利用SNP芯片进行玉米遗传多样性和群体遗传结构分析及新品种选育. 高嵩,刘宏伟,何欢,吕庆雪,周德龙,邢跃先,赵兴彦,张志军,张建新,仲义,夏远峰,宋广树. 2021

[10]SNP标记在玉米研究上的应用进展. 宁洽,刘文国,杨伟光,路明. 2017

[11]我国玉米品种标准DNA指纹库构建研究及应用进展. 赵久然,王凤格,易红梅,田红丽,杨扬. 2015

[12]玉米大斑病感、抗近等基因系SNP基因芯片分析. 马骏,王延波,刘欣芳,李明,弓雪,齐欣,姜敏. 2014

[13]玉米低密度育种芯片开发及在种质资源评价中的应用. 郭子锋,王山荭,刘蓓,李文学,王红武. 2022

[14]玉米高密度SNP遗传图谱构建及其秃尖QTL定位. 覃嘉明,王兵伟,郑加兴,覃永嫒,黄安霞,何静丹,韦绍丽,时成俏. 2020

[15]应用低密度SNP芯片解析玉米遗传多样性. 高嵩,张楠,何欢,郑淑波,赵桐,周小辉,代秀云,黄威,王薪淇. 2024

[16]利用SNP标记对51份玉米自交系进行类群划分. 吴金凤,宋伟,王蕊,田红丽,李雪. 2014

[17]利用核心SNP位点鉴别玉米自交系的研究. 宋伟,王凤格,田红丽,易红梅,王璐,赵久然. 2013

[18]吉林省玉米种质资源SSR和SNP分子身份证的构建及应用. 张茗起,王蕊,张春宵,孙擘,任洁,李淑芳,王璐,朱少喜,张江斌,施昕晨,王海杰,张云龙,田红丽,赵怡锟,匡猛,王元东,易红梅,李晓辉,王凤格. 2024

[19]玉米叶片硝酸盐积累性状的全基因组关联分析. 邬奇,孙扬名,桑俊伟,周玲,赵涵. 2024

[20]SSR和SNP标记在玉米分子标记辅助背景选择中的应用比较. 宋伟,赵久然,王凤格,田红丽,葛建镕,王元东,赵衍鑫. 2016

作者其他论文 更多>>