大白菜LEAFY新基因BrLFY1的生物信息学解析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李利斌
作者: 李利斌;李化银;刘国明;刘立锋;高建伟
作者机构:
关键词: 大白菜;LEAFY;结构分析;顺式元件;遗传进化
期刊名称: 山东农业科学
ISSN: 1001-4942
年卷期: 2009 年 10 期
页码: 11-14
摘要: 利用比较基因组学的方法从大白菜基因组序列中鉴定出一个新的LEAFY基因BrLFY1,并对它的序列特征、遗传进化和顺式元件进行了分析。结果表明,BrLFY1含有两个内含子,预测编码区为1260 bp,编码一个分子量为46.38 ku的蛋白。在进化上,BrLFY1与萝卜的RsLFY1关系最近,二者预测编码蛋白的序列一致性高达94.79%。另外,在BrLFY1的上游序列中存在多个激素和逆境应答元件。这说明大白菜LEAFY基因BrLFY1的表达可能不仅受多种激素的调节,还受多种逆境因子的影响。本研究为进一步研究BrLFY1在大白菜开花和逆境响应中的功能奠定了基础。
分类号: S634.1
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