环形泰勒虫微线体-棒状体蛋白基因侧翼序列的hiTAIL-PCR扩增及其生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 岑双庆

作者： 岑双庆;李有全;张晓;何海宁;刘志杰;陈泽;杨吉飞;关贵全;牛庆丽;刘爱红;任巧云;罗建勋;殷宏

作者机构：

关键词： 环形泰勒虫;RT-PCR;微线体-棒状体蛋白;hiTAIL-PCR;生物信息学分析

期刊名称： 中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2014 年 01 期

页码： 1-6

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为扩增环形泰勒虫微线体-棒状体蛋白基因的侧翼序列,从感染环形泰勒虫的淋巴细胞系中提取RNA,反转录合成第1链cDNA。以该cDNA为模板,利用高效热不对称交互PCR法(hiTAIL-PCR)进行扩增,将目的片段连接到pGEM-T Easy载体并进行测序。结果显示,获得了环形泰勒虫微线体-棒状体蛋白基因的5′端侧翼序列,该序列编码894个氨基酸。生物信息学分析结果表明,该蛋白具有信号肽,信号肽剪切部位位于第19~20个氨基酸残基之间,很可能是一种分泌蛋白;经TMHMM2.0预测,该蛋白在第875~892位氨基酸残基部位具有典型的跨膜结构;Motifscan预测的结果显示,环形泰勒虫微线体-棒状体蛋白存在2处N-糖基化位点(153NLSF、333NESM)和15处CK2蛋白激酶磷酸化位点;在该蛋白第500~650位氨基酸残基部分具有较高的抗原性,推测可能是该蛋白与其他蛋白发生相互作用的区域。

分类号： S852.7

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