中国牛病毒性腹泻病毒JZ05-1分离株全基因测序及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李庆超

作者： 李庆超;苗利光;李海涛;刘艳环;张广雷

作者机构：

关键词： BVDV;全基因组;基因型;相似性

期刊名称： 病毒学报

ISSN： 1000-8721

年卷期： 2010 年 03 期

页码： 80-85

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 牛病毒性腹泻病毒为瘟病毒属成员,呈世界性分布并在乳/肉牛业中造成严重经济损失。本研究利用MD-BK细胞增殖一株分离于我国吉林地区的牛源牛病毒性腹泻病毒JZ05-1毒株,观察发现其具有典型的致细胞病变效应。使用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)方法分别扩增覆盖基因组全长的八个片段并测序,拼接获得该病毒的全基因组序列长12285核苷酸(nt),GenBank登录号:GQ888686。该病毒基因组具有编码多聚蛋白的一个11694nt可读框,5'非翻译区(UTR)长387nt,3'非翻译区长204nt。分别分析BVDVJZ05-1的5'-UTR序列和全基因组序列,发现该病毒属于BVDV-2a亚型。BVDV-2型多数毒株之间的相似性约为96%,与JZ05-1全基因组序列相似性最高的加拿大p11Q毒株和中国XJ-04毒株的相似性为90%和91%。因此,JZ05-1全基因组序列与BVDV-2型其他毒株的全基因组序列具有较大差异。

分类号： S852.659.6

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