铁皮石斛尿苷二磷酸糖基转移酶(UGT)基因家族鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈家栋

作者： 陈家栋;姜武;宋敏全;周银君;李亚萍;段晓婧;陶正明

作者机构： 浙江省亚热带作物研究所;浙江铁枫堂生物科技股份有限公司;乐清市大荆镇人民政府

关键词： 铁皮石斛;尿苷二磷酸糖基转移酶（UGT）;基因表达;系统进化分析

期刊名称： 中国中药杂志

ISSN： 1001-5302

年卷期： 2023 年 007 期

页码： 1840-1850

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 尿苷二磷酸糖基转移酶（UGT）是一个在植物中高度保守的蛋白，通常在次生代谢途径中起作用。该文利用隐马可列夫模型（HMM）在铁皮石斛Dendrobium officinale全基因组中进行UGT基因家族成员筛选，共得到44个UGT家族成员。利用生物信息学对铁皮石斛基因的结构、系统进化以及启动子区域原件进行分析，结果表明，UGT基因家族可分为4个亚家族，各亚家族中UGT基因具有相对保守的基因结构，拥有9个保守的结构域。UGT基因上游启动子区含有多种植物激素及环境因子相关的顺式作用元件，表明UGT基因的表达可能会受到植物激素和外界环境因素的诱导，比较铁皮石斛不同组织中UGT基因的表达，发现UGT基因在铁皮石斛各个部位中均有表达，可以推测UGT基因在铁皮石斛多个组织的中发挥着重要作用。通过对铁皮石斛菌根共生低温胁迫、缺磷胁迫的转录组分析，该研究发现仅有一个基因在菌根共生和低温、缺磷胁迫下均上调表达。该研究结果有助于了解兰科植物UGT基因家族的功能，为深入研究铁皮石斛多糖代谢途径的分子调控机制提供理论基础。

分类号： S567.239

  • 相关文献

[1]映山红杜鹃MADS基因家族的鉴定与分析. 杨丽,严露露,李慧娥,杜致辉,郑淇元. 2021

[2]陆地棉油菜素内酯信号基因GhBES1家族的鉴定及表达分析. 束红梅,郭书巧,巩元勇,蒋璐,朱静雯,倪万潮. 2017

[3]△12-脂肪酸脱氢酶及其编码基因研究进展. 刘永红,张丽静,张洪荣,傅华. 2011

[4]绵羊附红细胞体部分16S rRNA基因序列测定和系统进化分析. 何立雄,黄新,杨华,张云峰,郑金海,周建国,徐雪平,钟发刚. 2009

[5]果实软化相关PG基因的进化分析和基因组定位. 魏潇,刘威生,刘宁,章秋平,张玉萍,刘硕,刘有春. 2011

[6]小麦TaSnRK2.9蛋白激酶基因克隆与生物信息学分析. 连魏卫,唐益苗,高世庆,张朝,赵昌平. 2011

[7]胡麻SUC基因家族的鉴定与生物信息学分析. 齐燕妮,李闻娟,王利民,赵玮,党照,谢亚萍,张建平. 2019

[8]雷蒙德氏棉HSP70基因家族的进化分析及其同源基因在陆地棉中的表达分析. 张毓婷,王敏华,陈家栋,戎均康,丁明全. 2014

[9]长穗偃麦草EeDREB2基因的克隆与生物信息学分析. 孙珊珊,杨涛,柳珊,陈京瑞,赵昌平,唐益苗,高世庆. 2013

[10]柑橘黄龙病病原菌的鉴定及16S rDNA序列分析. 孙大光,郑雪芳,刘波,阮传清,夏育陆,段永平. 2011

[11]高粱基因组DCL家族的系统进化与表达分析. 张腾,尹梦娇,郭红媛,姜晓东,贾举庆,王艳胜,温贺,梁月秀,赵立松,赵威军,吕晋慧,李艳锋,张春来. 2019

[12]亚麻COBRA基因家族的鉴定与生物信息学分析. 齐燕妮,李闻娟,王利民,赵玮,党照,谢亚萍,张建平. 2019

[13]基于mtCOI基因序列的中国葱斑潜蝇不同地理种群遗传多样性分析. 钟裕俊,杜素洁,潘立婷,王玉生,王福莲,刘万学. 2020

[14]菜粉蝶Pain离子通道基因的克隆和功能研究. 毛芬,张晓宇,黄佳,叶恭银. 2020

[15]江苏葫芦科作物上瓜类褪绿黄化病毒的发生及其分离物全基因组序列分析. 杨柳,任春梅,陆芳,缪倩,程兆榜,季英华. 2024

[16]MIC5基因在13株不同基因型的刚地弓形虫中的序列变异（英文）. 刘文阁,徐晓佩,陈佳,朱兴全,徐前明. 2015

[17]海南豇豆枯萎病病原鉴定及生物学特性初步研究. 肖敏,曾向萍,严婉荣,吉训聪,王会芳,赵志祥. 2015

[18]StGID1基因调控马铃薯植株高度、直径和叶绿素含量. 李华鹏,彭小荷,梁晓,唐铭霞,王克秀,胡建军. 2024

[19]黄瓜绿斑驳花叶病毒基因组全序列分析及病害的田间调查. 肖彩利,郑红英,吴晓花,李国景,燕飞,陈剑平. 2016

[20]大豆β-1,3-葡聚糖酶(GmBG1)及其同源蛋白的生物信息学分析. 张丽,魏崃,唐晓飞,王伟威,于志远,刘丽君. 2017

作者其他论文 更多>>

微信小程序