铁皮石斛DoUGT83A1基因克隆及表达特性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张逸群

作者： 张逸群;陈家栋;宋敏全;姜武;刘莹莹;段晓婧;陶正明

作者机构：

关键词： 铁皮石斛;DoUGT83A1基因;生物信息学分析;表达特性分析;qRT-PCR

期刊名称： 中草药

ISSN： 0253-2670

年卷期： 2025 年 56 卷 001 期

页码： 259-268

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 目的 对铁皮石斛Dendrobium officinale中糖基转移酶基因DoUGT83A1进行克隆，并对其进行生物信息学及表达模式分析。方法 从铁皮石斛“雁荡山1号”叶组织中获得DoUGT83A1基因，利用软件进行生物信息学分析，利用MEGA11构建系统发育树，采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测基因表达模式。结果 通过PCR扩增得到1个DoUGT83A1基因（GI:1622023669），该基因的CDS序列为1 347 bp，编码448个氨基酸。DoUGT83A1蛋白相对分子质量为54 330，理论等电点为5.75，为亲水性不稳定蛋白，无信号肽和跨膜区域，含有41个磷酸化位点，具有UDPGT和PSPG 2个保守结构域。氨基酸序列分析表明DoUGT83A1蛋白与金钗石斛Dendrobium nobile的UGT83A1蛋白的同源性最高，相似度为96.36%。分子对接结果证明DoUGT83A1蛋白对山柰酚具有较好的催化活性。组织特异性表达分析结果显示，DoUGT83A1在“雁荡山1号”不同组织相对表达量为：叶>茎>花>根（白根、绿根尖）。顺式作用元件分析结果表明，DoUGT83A1基因启动子序列含有多个与非生物胁迫响应相关的元件，且在低温、缺磷和菌根共生诱导下显著上调表达，推测该基因可能参与调控铁皮石斛菌根共生及非生物胁迫响应过程。结论 成功克隆获得铁皮石斛DoUGT83A1基因，并进行生物信息学分析和基因表达模式分析。为进一步探究DoUGT83A1基因功能及其在菌根共生和非生物胁迫响应中的作用机制提供理论依据。

分类号： S567.239

  • 相关文献

[1]陆地棉耐碱基因GHZAT12的克隆、表达及生物信息学分析. 范亚朋,范亚朋,芮存,张悦新,陈修贵,陆许可,王帅,张红,徐楠,王晶,陈超,叶武威. 2021

[2]细粒棘球绦虫TSP2基因的克隆及生物信息学分析. 王宁,赵鹏鹏,张艳艳,马勋,王正荣,薄新文. 2021

[3]棉花GhDMT7基因对5-氮杂胞嘧啶核苷的响应机制. 杨志宁,陆许可,范亚朋,孙玉平,喻欣,王亮,高永健,古丽加依那什·哈不力,古丽沙西·拿斯依,吾木尔·阿不都,黄慧,张梦豪,王立东,陈筱,肖磊,张鑫蕊,王帅,陈修贵,王俊娟,郭丽雪,高文伟,叶武威. 2025

[4]铁皮石斛鲨烯单加氧酶基因的克隆与表达分析. 林江波,王伟英,邹晖,戴艺民. 2020

[5]铁皮石斛糖苷水解酶GH3基因家族鉴定及表达模式分析. 李亚萍,金福来,黄宗贵,张涛,段晓婧,姜武,陶正明,陈家栋. 2024

[6]蜻蜓凤梨AfERF109基因的克隆及响应乙烯的表达特性分析. 雷明,王之,王加宾,李志英,徐立. 2016

[7]水稻种胚特异性启动子OsESP1的克隆及其表达特性. 房孝良,刘炜,安静,王庆国. 2011

[8]粟弯孢霉叶斑病菌钙调磷酸酶基因克隆及表达分析. 李志勇,朱彦彬,赵会薇,董立,董金皋,董志平. 2013

[9]QRT-PCR检测目的基因mRNA转录水平的应用. 韩天龙,王敏,李志明. 2011

[10]茶树冷诱导基因的AFLP筛选及其表达分析. 陈林波,李叶云,房超,朱政,江昌俊. 2011

[11]辣椒AP2/ERF家族转录因子CaERF109的克隆和表达分析. 高升华,李宁,王飞,尹延旭,余楚英,焦春海,姚明华. 2019

[12]公鸡鸡冠发育相关候选基因的表达分析. 王琨,刘一帆,章明,屠云洁,姬改革,单艳菊,巨晓军,束婧婷,虞徳兵. 2017

[13]基于CRISPR/Cas9技术的水稻pi21基因编辑材料的创制及稻瘟病抗性鉴定. 杨海河,毕冬玲,张玉,邹小维,高晓庆,袁正杰,曲海艳,何海燕,瞿绍洪. 2017

[14]文心兰FT同源基因的克隆及其表达分析. 林榕燕,方能炎,罗远华,黄敏玲,叶秀仙,钟淮钦. 2019

[15]普通白菜1,5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶小亚基基因Bcrbc S的克隆及表达分析. 刘东让,侯喜林,肖栋. 2019

[16]沪农灵芝一号生长过程中子实体各部位糖醇和海藻糖积累及其代谢酶的表达变化. 周帅,张晓昱,唐传红,马富英,唐庆九,张劲松. 2018

[17]谷子抗病相关基因SiRAR1的克隆及表达分析. 白辉,宋振君,宋丹丹,王永芳,全建章,董志平,李志勇. 2019

[18]荷花淹水胁迫下实时定量PCR内参基因的验证. 徐君,江君,王欢,姜红卫. 2019

[19]转基因大豆MON89788实时荧光重组酶聚合酶扩增检测方法的建立. 谢实龙,汪小福,丁晨露,祝旋,汤婷,马同富,蔡健,徐俊锋. 2019

[20]小麦春化作用相关基因的时空表达特性研究. 冯岳,徐尧,褚蔚,隋新霞,黄承彦,崔德周,樊庆琦,楚秀生. 2017

作者其他论文 更多>>

微信小程序