水牛ApoB基因多态性与泌乳性状关联分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 林雨昕

作者: 林雨昕;曹家瑄;孙晖;李俊;李华钊;吴祺鹏;邓廷贤;杨利国;滑国华

作者机构:

关键词: 水牛;ApoB;泌乳性状;性状关联分析;基因多态性

期刊名称: 基因组学与应用生物学

ISSN: 1674-568X

年卷期: 2022 年 006 期

页码: 1180-1192

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究旨在探究水牛(Bubalus bubalis)载脂蛋白B基因(ApoB)在地中海水牛群体中的遗传多态性,并与地中海水牛泌乳性状进行关联分析,筛选水牛产奶性状分子标记。本研究以350头地中海纯种奶水牛为研究对象,利用直接测序法和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)法筛选基因多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)与基因分型,并进一步分析单倍型与泌乳性状的相关性。结果显示,在地中海水牛群体ApoB基因中筛选到10个SNPs,分别位于启动子(g.-1718A>G、g.-1823G>C和g.-2063A>C)、第7内含子(g.8105G>A)、第26内含子(g.30643G>A)、第5外显子(g.5903G>A)、第26外显子(g.30879T>C、g.33638A>C和g.37375G>A)和第29外显子(g.40787A>G)区域。10个SNPs位点多态信息含量均大于0.25且小于0.5,属于中度多态。其中g.-1718A>G、g.-1823G>C、g.-2063A>C、g.37375G>A和g.40787A>G突变位点与地中海水牛乳蛋白率显著相关,g.5903G>A和g.40787A>G位点与地中海水牛乳脂率显著相关,g.37375G>A与地中海水牛270天乳蛋白量和乳脂量显著相关。单倍型Block1(g.-1718A>G、g.-1823G>C和g.-2063A>C)与270天乳蛋白量和乳蛋白率显著相关;单倍型Block2(g.30643G>A和g.33638A>C)与270天乳脂含量、乳脂率、270天乳蛋白量以及乳蛋白率显著相关;单倍型Block3(g.37375G>A和g.40787A>G)与乳蛋白率显著相关;g.33638A>C、g.37375G>A、g.40787A>G以及单倍型Block2和Block3突变型蛋白质理化性质和二级结构发生改变。本研究共筛选到6个SNPs和3个单倍型Block与水牛泌乳性状显著相关,其中单倍型Block2的H3H3为最优单倍型,可作为水牛产奶性状潜在分子标记。

分类号: S823.83

  • 相关文献

[1]中国水牛乳蛋白基因多态性与乳蛋白组成的关联研究. 刘亚楠,任大喜,刘建新,李玲,曾庆坤. 2016

[2]猪MBF1基因的多态性及与生产性状的关联分析. 武华玉,程碧军,乔木,刘贵生,吴俊静,李良华,彭先文,梅书棋. 2016

[3]刀鲚内皮素1基因SNP多态性及其与颌骨性状相关联分析. 高俊,周琳,聂志娟,王耀辉,徐钢春. 2023

[4]猪USF1基因的多态性及与生产性状的关联分析. 武华玉,乔木,黄京书,刘贵生,彭先文,李良华,吴俊静,梅书棋. 2014

[5]猪RTL1基因多态性及其与胴体、肉质性状的关联分析. 乔木,程碧军,武华玉,胡华,吴俊静,刘贵生,梅书棋,彭先文. 2017

[6]猪ACADL基因单核苷酸多态性及其与脂肪沉积性状的关联分析. 乔木,郭咪咪,武华玉,吴俊静,王德才,刘贵生,梅书棋,彭先文. 2018

[7]湖羊催乳素基因多态性与泌乳性状的相关性分析. 李晓林,牛志刚,袁燕,王珊,李列刚,史洪才. 2015

[8]湖羊和小尾寒羊骨形成蛋白受体IB型基因多态性与泌乳性状的相关性分析. 李晓林,牛志刚,袁燕,李列刚,周成全,史洪才. 2016

[9]中国荷斯坦牛κ-酪蛋白基因第4和第5外显子多态性与泌乳性状的关联分析. 鞠志花,王洪梅,李秋玲,黄金明,李建斌,安利国,杨桂文,仲跻峰,王长法. 2009

[10]华南地区荷斯坦牛泌乳性能在季节、胎次、泌乳时期影响下的变化规律. 童雄,王秀娟,李大刚,朱恒乾,丁迪云,闵力,徐斌,王刚. 2018

[11]麦洼牦牛和九龙牦牛乳蛋白遗传多态性的研究. 毛永江,钟光辉,郑玉才,彭先文,杨章平,王永,江明峰. 2003

[12]草原红牛κ-酪蛋白基因的多态性及与泌乳性状关联性分析. 申瑞雪,郭将,马倩,赵衍铜,李传民,邱峥艳,高妍,张国梁,赵志辉,张永宏. 2012

[13]疆岳驴催乳素受体基因多态性及其与泌乳性状间的相关性分析. 毕兰舒,肖海霞,臧长江,何美升,托乎提·阿及德,帕热哈提江·吾甫尔,于茜,刘武军. 2017

[14]草原红牛二酞甘油酞基转移酶2(DGAT2)基因的多态性及与泌乳性状关联性分析. 郭将,马双羽,申瑞雪,耿智慧,尹璐,高妍,张国梁,杨润军,张永宏. 2012

[15]蒙荷杂交牛与荷斯坦牛重要经济性状的比较研究. 陈坤琳,夏淑雯,连红,沈阳阳,赵芳,丁强,崔兆康,仲跻峰,田雨,王慧利. 2024

[16]农业反刍动物重要乳性状表型测定方法及研究进展. 王语浓,唐永杰,张雅丽,苏峰,张俊,张毅,王雅春,俞英. 2023

[17]河北地区中国荷斯坦奶牛GHR基因F279Y位点多态性与泌乳性状遗传效应分析. 王思伟,王学清,石少轻,李元迎,王昆. 2018

[18]河北地区中国荷斯坦牛DGAT1基因多态性与泌乳性状遗传效应分析. 王思伟,王学清,石少轻,马亚宾,王昆. 2019

[19]牛CAPN3基因多态性及与肉质性状相关性分析. 柳思源,徐靖博,任久生,于汪洋,杨连玉,邓琼,姜昊,马腾壑,赵志辉,贾丽坤,贾丽伟,赵玉民,张嘉保. 2011

[20]中国部分绵羊品种BMPR-IB基因RFLP多态性的研究. 刘凤丽,刘永斌,王峰,王瑞,田春英,刘美霞,魏建民,荣威恒. 2007

作者其他论文 更多>>