基于转录组的茎用莴苣抽薹相关差异表达基因分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 武一

作者： 武一;孙雪梅;杨世鹏;谭龙;王丽慧

作者机构：

关键词： 茎用莴苣;抽薹;转录组;差异表达基因

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2024 年 004 期

页码： 711-720

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究影响茎用莴苣抽薹的相关关键基因，采用高通量转录组测序的方法，研究茎用莴苣产品器官收获期和抽薹期的差异表达基因。结果表明，茎用莴苣种质资源1号在产品器官收获期和抽薹期的差异表达基因数量为6 754个，茎用莴苣种质资源3号在产品器官收获期和抽薹期的差异表达基因数量为5 444个。基因本体（GO）功能富集分析结果表明，差异表达基因主要富集在结合、催化活性、细胞过程、代谢过程、细胞解剖实体等GO条目中。京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析结果表明，茎用莴苣种质资源1号和茎用莴苣种质资源3号分别有133条和129条KEGG代谢通路，其中有128条代谢通路在2份种质资源中均被注释；差异表达基因富集较多的KEGG代谢通路有次生代谢物的生物合成、植物激素信号转导、植物-病原体的相互作用等。转录因子分析结果表明，茎用莴苣产品器官收获期和抽薹期的差异表达基因大多数属于AP2/ERF、bHLH、bZIP、C2H2、MYB、NAC、WRKY等转录因子家族。对茎用莴苣产品器官收获期和抽薹期差异表达基因的研究结果进行综合分析，发现在AP2/ERF、WRKY、bHLH等转录因子家族以及次生代谢物的生物合成、植物激素信号转导等通路中存在较多的差异表达基因，推测这些转录因子家族和代谢通路可能参与茎用莴苣抽薹的调控网络。本研究结果为解析茎用莴苣抽薹相关基因及其分子机制奠定了基础。

分类号： S636.2

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