轮叶党参EST-SSR标记的开发及在党参属中的应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘新星

作者： 刘新星;石有太;罗俊杰;欧巧明;陈子萱;李忠旺

作者机构：

关键词： 轮叶党参;EST-SSR;党参属;分子标记;鉴别

期刊名称： 中草药

ISSN： 0253-2670

年卷期： 2018 年 13 期

页码： 3110-3115+3121

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 目的开发EST-SSR标记,分析其在党参属及近缘属种间的通用性。方法利用MISA软件对轮叶党参在NCBI公布的EST序列进行SSR位点查找,Primer 3.0软件设计引物,经PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳对引物进行初步筛选,聚丙烯酰胺凝胶电泳对所筛选的引物进行多态性检测。结果共查找到204个EST-SSR位点,总长5 263 bp,平均长度25.80 bp,出现频率为22.97%,其中单核苷酸、二核苷酸和六核苷酸重复占比最多,分别为36.8%、24.8%和15.3%。单核苷酸、二核苷酸、六核苷酸中的主要重复基元类型是A、TG和CAGCTC/GTGGCA。共设计引物112对,以党参为模板,能够扩增出清晰稳定条带的引物有67对,有效引物比率59.82%,其中27对能扩增出多态性条带,多态引物比率24.11%。随机选取5对引物对党参属及桔梗共12份材料进行PCR扩增,聚类结果将党参属和桔梗属分为2大类。结论研究筛选出的EST-SSR标记能够在党参属及近缘属内进行区分鉴别,研究结果为党参种质鉴别、遗传多样性分析及资源的评价利用等提供了重要技术手段。

分类号： S567.53

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