金线莲应答高温胁迫的转录组学特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 梅瑜

作者： 梅瑜;王继华;蔡时可

作者机构：

关键词： 金线莲;高温胁迫;转录组测序;基因注释;差异表达基因

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2023 年 39 卷 003 期

页码： 97-103

收录情况： CSCD

摘要： 为了研究高温胁迫下金线莲转录组表达特征,分析其热激响应机制.以正常培养和高温胁迫(45℃)的金线莲(NYJ2)为材料,利用Illumina HiSeq?2000平台进行测序,通过Trinity软件进行De novo组装.结果共获得75688个unigene,有28323个unigene在Nr、KOG、KEGG和Swisspro数据库中得到功能注释,注释率为37.42%.其中,17532个unigene在KOG数据库中可归类到25个功能家族;10108个unigene被KEGG数据库注释到128个代谢途径中;17485个unigene被GO数据库的生物过程、分子功能和细胞组成三大功能注释到47个条目中.777个unigene在高温胁迫前后差异表达显著,其中胁迫后上调表达为362个,下调表达为415个,获得响应热胁迫的基因24个,包括热激蛋白的基因1个,PS Ⅰ和PSⅡ相关的基因15个、叶绿体rbcL基因3个、PLD基因2个,CAT编码基因、GAPDH基因、CYP编码基因各1个.本研究从转录组水平分析了金线莲对热胁迫的响应,这些数据将为功能基因的鉴定奠定基础,为培育耐高温金线莲品系提供了参考依据.

分类号： S567.9

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