穿心莲TCP基因家族全基因组鉴定及非生物胁迫下的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张龙

作者： 张龙;徐世强;李静宇;胡学博;顾艳;王继华

作者机构：

关键词： 穿心莲;TCP转录因子;基因家族;非生物胁迫

期刊名称： 中国中药杂志

ISSN： 1001-5302

年卷期： 2024 年 49 卷 002 期

页码： 379-388

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 穿心莲是我国岭南地区重要的药用植物,具有清热解毒、抗菌消炎等功效.TCP基因家族是调控植物生长发育和胁迫响应的一类转录因子.为解析TCP 基因家族成员在穿心莲非生物胁迫下的作用,该研究基于全基因组水平鉴定穿心莲TCP基因家族,并进行了其响应非生物胁迫的表达模式分析.结果表明,穿心莲TCP基因家族共有 23 个成员,氨基酸长度为136~508 aa,相对分子质量为 14 854.71~55 944.90 kDa,等电点为 5.67~10.39,均定位于细胞核,不均匀分布于 13 条染色体上,系统进化分析将其划分为 3 个亚家族:PCF、CIN和CYC/TB1.基因结构和保守基序分析显示绝大多数TCP基因家族成员均含有相同排列顺序的motif 1、motif 2、motif 3 和 1~3 个CDS.启动子顺式作用元件分析表明穿心莲TCP基因家族的转录表达可能受光、激素和逆境胁迫的诱导;结合TCP 基因家族响应逆境胁迫的表达模式分析和qRT-PCR验证,预测到ApTCP4、ApTCP5、ApTCP6 和ApTCP11 可能参与响应干旱、高温和MeJA等多种非生物胁迫.该研究为深入挖掘穿心莲TCP基因响应非生物胁迫下的功能奠定基础.

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