穿心莲TCP基因家族全基因组鉴定及非生物胁迫下的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张龙

作者： 张龙;徐世强;李静宇;胡学博;顾艳;王继华

作者机构：

关键词： 穿心莲;TCP转录因子;基因家族;非生物胁迫

期刊名称： 中国中药杂志

ISSN： 1001-5302

年卷期： 2024 年 49 卷 002 期

页码： 379-388

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 穿心莲是我国岭南地区重要的药用植物,具有清热解毒、抗菌消炎等功效.TCP基因家族是调控植物生长发育和胁迫响应的一类转录因子.为解析TCP 基因家族成员在穿心莲非生物胁迫下的作用,该研究基于全基因组水平鉴定穿心莲TCP基因家族,并进行了其响应非生物胁迫的表达模式分析.结果表明,穿心莲TCP基因家族共有 23 个成员,氨基酸长度为136~508 aa,相对分子质量为 14 854.71~55 944.90 kDa,等电点为 5.67~10.39,均定位于细胞核,不均匀分布于 13 条染色体上,系统进化分析将其划分为 3 个亚家族:PCF、CIN和CYC/TB1.基因结构和保守基序分析显示绝大多数TCP基因家族成员均含有相同排列顺序的motif 1、motif 2、motif 3 和 1~3 个CDS.启动子顺式作用元件分析表明穿心莲TCP基因家族的转录表达可能受光、激素和逆境胁迫的诱导;结合TCP 基因家族响应逆境胁迫的表达模式分析和qRT-PCR验证,预测到ApTCP4、ApTCP5、ApTCP6 和ApTCP11 可能参与响应干旱、高温和MeJA等多种非生物胁迫.该研究为深入挖掘穿心莲TCP基因响应非生物胁迫下的功能奠定基础.

分类号：

  • 相关文献

[1]全基因组水平金银花TCP基因家族的鉴定及表达模式分析. 谭政委,郭水柱,苏小雨,孙瑶,余永亮,李磊,张利超,许兰杰,鲁丹丹,安素妨,李春明,梁慧珍,王子君. 2024

[2]基于苋菜转录组的TCP基因家族成员鉴定及表达分析. 安子贤,李宜轩,郑友峰,肖昉,王乐,陈何,赖钟雄,牟建梅,刘生财. 2022

[3]穿心莲R2R3-MYB基因家族的鉴定与表达分析. 李静宇,孙铭阳,徐世强,孙伟,顾艳,梅瑜,王继华. 2022

[4]谷子SHMT基因家族全基因组鉴定与表达分析. 郭冰,秦家范,李娜,宋梦瑶,王黎明,李君霞,马小倩. 2025

[5]高粱PLC基因家族全基因组鉴定及其对非生物胁迫的响应表达分析. 简子林,王自力,秦畅,陈松树,刘晓娟,何方,任明见. 2024

[6]二倍体马铃薯StBRC1a功能缺失突变体的获得及其功能分析. 冯爽爽,罗嘉翼,朱曦鉴,蒋继滨,黄三文,张金喆. 2020

[7]马铃薯TCP基因家族全基因组鉴定与分析. 肖熙鸥,林文秋,冯雪峰,高晓敏,邹华芬,李可,金辉. 2018

[8]花生TCP转录因子的全基因组鉴定及组织表达特性分析. 王通,赵孝东,甄萍萍,陈静,陈明娜,陈娜,潘丽娟,王冕,许静,禹山林,迟晓元,张建成. 2021

[9]植物TCP蛋白作用机制研究进展. 李文略,柳婷婷,陈常理,骆霞虹,安霞,邹丽娜,朱关林,李苹芳. 2023

[10]植物TCP转录因子的作用机理及其应用研究进展. 冯志娟,徐盛春,刘娜,张古文,胡齐赞,龚亚明. 2018

[11]油棕TCP转录因子家族生物信息学鉴定及基因表达分析. 周丽霞,赵志浩,杨蒙迪,曹红星,杨耀东. 2022

[12]芦竹TCP家族的基因鉴定与盐胁迫下的表达分析. 刘璇,陈虞超,郭生虎,钟楠,石磊,甘晓燕. 2024

[13]罗汉果SgTCP6基因克隆、生物信息学分析及转录激活研究. 林孝东,莫长明,穆德添,赵欢,黄华学,邵瑛瑛,陈文强,刘代,梁任繁,唐其. 2025

[14]芦竹TCP家族的基因鉴定与盐胁迫下的表达分析. 刘璇,陈虞超,郭生虎,钟楠,石磊,甘晓燕. 2024

[15]优质穿心莲GAP种植技术. 邱道寿,王泽清,白春华,陈元生,陈俊标,李淑玲,谭铭喜,张振臣. 2008

[16]穿心莲茉莉酸甲酯及非生物胁迫下Real-time PCR内参基因的筛选. 李静宇,孙铭阳,徐世强,梅瑜,顾艳,周芳,孙伟,王继华. 2022

[17]药用植物穿心莲研究进展. 周芳,孙铭阳,梅瑜,顾艳,徐世强,李静宇,蔡时可,王继华. 2021

[18]甲基磺酸乙酯对穿心莲种子成苗的影响. 周芳,梅瑜,顾艳,蔡时可,王继华. 2020

[19]外施茉莉酸甲酯对穿心莲耐盐性的影响. 温赛群,姜涛,温春秀,刘灵娣,田伟,谢晓亮. 2020

[20]漳浦县穿心莲产业发展状况分析. 杨有泉,林忠宁,陈国平. 2014

作者其他论文 更多>>

微信小程序