桔梗不同花色实时定量PCR内参基因的筛选及验证

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马璐琳

作者： 马璐琳;段青;王祥宁;杜文文;贾文杰;李想;崔光芬;王继华

作者机构：

关键词： 桔梗;内参基因;RT-qPCR;基因表达;类黄酮/花青素苷合成途径

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2025 年 23 卷 018 期

页码： 6234-6242

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了筛选适用于桔梗类黄酮/花青素苷合成途径基因表达情况RT-qPCR分析的内参基因,本研究根据已完成的桔梗蓝、紫、白3种花色花器官的转录组测序结果,选取了水通道蛋白基因(aquaporin,4QP)、微管蛋白基因(α-tubulin,α-TUB)、肌动蛋白基因(β-actin,β-A CT)、磷酸甘油醛脱氢酶基因(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)、亲环蛋白基因(cyclophilin,CYP)、转录延伸因子基因(elongation factor 1-α,EF-1α)、组蛋白基因(histone,HIS)、60S 核糖体蛋白基因(60S ribosomal protein L13-1,RPL13)和多聚泛素酶基因(polyubiquitin,UBQ)等9个常用看家基因作为候选内参基因,利用RT-qPCR对候选内参基因在桔梗不同组织器官中的表达情况进行检测分析,通过NormFinder、geNorm和BestKeeper 3个不同软件比较评价它们的表达稳定性.最终从9个候选内参基因中筛选出表达最稳定的RPL13,以RPL13作为内参基因,对桔梗类黄酮/花青素苷合成途径部分基因进行RT-qPCR分析,结果与转录组测序结果相吻合.因此RPL13是桔梗类黄酮/花青素苷合成途径基因表达分析的最适内参基因.本研究为桔梗花色素合成途径基因表达分析提供了合适的内参基因.

分类号： S567.239

  • 相关文献

[1]双孢蘑菇内参基因的筛选与矫正. 赵建霞,沈颖越,冯伟林,金群力,宋婷婷,范丽军,蔡为明. 2019

[2]花椰菜花球中花青素合成相关基因RT-qPCR内参基因的筛选. 张冠,杨迎霞,陆国清,陈锐,王倩,王梦梦,李荣,姚星伟. 2024

[3]大蒲莲猪不同发育阶段组织RT-qPCR分析中适宜内参基因筛选. 王彦平,朱荣生,王怀中,王诚,呼红梅. 2018

[4]XTH基因家族在'妃子笑'荔枝花穗不同处理方式的表达分析. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2021

[5]印度谷螟实时荧光定量PCR内参基因的选择. 唐培安,张棋麟,薛昊,袁明龙. 2016

[6]二化螟实时荧光定量PCR内参基因筛选和表达稳定性评价. 徐红星,王国荣,鲁艳辉,杨亚军,郑许松,田俊策,吕仲贤. 2019

[7]六点始叶螨内参基因筛选及其在超氧化物歧化酶基因EsSOD表达分析中的应用. 梁晓,陈青,伍春玲,方永军. 2021

[8]秋石斛RT-qPCR内参基因的筛选与验证. 侯天泽,易双双,张志群,王健,李崇晖. 2022

[9]植物实时荧光定量PCR内参基因的选择. 胡瑞波,范成明,傅永福. 2009

[10]免疫刺激后小鼠肝脏内参基因稳定性研究. 董晓丽,王加启,卜登攀,刘光磊,李旦,张春刚,程金波,魏宏阳,周凌云,赵国琦. 2009

[11]比较不同免疫处理小鼠肝脏中内参基因的稳定性. 董晓丽,王加启,卜登攀,刘光磊,张春刚,程金波,李旦,魏宏阳,周凌云,赵国琦. 2008

[12]内参基因对TYR、MITF和ASIP基因在白绒乌骨鸡各组织表达水平的影响. 郑嫩珠,李丽,辛清武,缪中纬,朱志明,刘凤辉,吴俭飞,卢立志. 2015

[13]稻螟赤眼蜂实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 王珊珊,田俊策,鲁艳辉,徐红星,王香萍,吕仲贤. 2022

[14]低温弱光胁迫下茄子幼苗实时荧光定量PCR内参基因的筛选与评价. 林珲,裘波音,朱海生,温庆放. 2024

[15]BMP6基因在单、双羔蒙古羊不同生理时期卵巢组织中的差异表达及分析. 杨燕燕,杜文,刘永斌,达来,王标,青格勒,周璇,何亭漪,乌达巴拉,田瑛. 2017

[16]种球包衣剂防治魔芋软腐病试验研究. 杨群辉,何翔,杨佩文,毕云青,张庆,曾波,任思宇,施竹凤,杨明英,谢美华. 2020

[17]不同日龄和羽型太行鸡卵巢繁殖调控基因的表达分析. 张乐超,王晗,张秀玲,王麒,周荣艳,李兰会,李祥龙. 2019

[18]梨小食心虫几丁质合成酶1基因的克隆与表达分析. 杨静,高越,刘中芳,张鹏九,樊建斌,牛国飞,韩召军,范仁俊. 2017

[19]棉花根系分泌物对枯草芽胞杆菌NCD-2菌株趋化性的影响. 董丽红,郭庆港,张晓云,赵卫松,王培培,苏振贺,鹿秀云,李社增,马平. 2019

[20]PhoR/PhoP双组分系统对枯草芽胞杆菌NCD-2菌落形态和芽胞形成的影响. 郭庆港,王培培,董丽红,苏振贺,张晓云,宋健,赵卫松,鹿秀云,李社增,马平. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序