菊苣TCP基因家族鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杜洋

作者： 杜洋;张智韦;陆爽;刘雪;李大勇;徐朝阳;王晨晨;张彬;许立新

作者机构： 北京林业大学草业与草原学院;中煤科工生态环境科技股份有限公司;北京市农林科学院蔬菜所

关键词： TCP基因家族;菊苣;表达分析;家族分析

期刊名称： 草地学报

ISSN： 1007-0435

年卷期： 2024 年 32 卷 008 期

页码： 2428-2439

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： TCP转录因子参与调控植物多种生理过程，包括植物叶片发育、花发育、分枝的形成等方面。菊苣(Cichorium intybus L.)是一种优良牧草，但目前还未有关于其TCP基因家族研究的报道。本研究基于菊苣全基因组数据，利用拟南芥(Arabidopsis thaliana)、生菜(Lactuca sativa L.)TCP基因家族的氨基酸序列，对菊苣TCP基因家族成员进行鉴定筛选，最终得到39个菊苣TCP基因家族成员。接着利用生物信息学方法对这些成员进行分析发现，39个成员不均匀分布在9条染色体上；氨基酸数目为113～498,分子量为12 425.84～56 266.57Da;所有成员分为3个亚家族；均含有保守的basic-helix-loop-helix(bHLH)结构域；顺式作用元件分析发现，菊苣TCP家族成员具有多种激素、非生物胁迫和生长发育响应元件；对CIN类TCP基因在菊苣各组织和高温胁迫下进行表达分析发现，这些成员可能参与菊苣的叶片发育调控且对高温胁迫响应。本研究可以为改良菊苣牧草品质提供理论依据。

分类号： S548

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