整合转录组数据鉴定大型真菌原基形成的潜在通路

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨驰

作者： 杨驰;马璐;肖冬来;江晓凌;刘晓瑜;应正河;林衍铨

作者机构：

关键词： 大型真菌;转录组测序;原基形成;环境因子

期刊名称： 微生物学通报

ISSN： 0253-2654

年卷期： 2022 年 49 卷 002 期

页码： 556-568

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [背景]大型真菌子实体发育特别是从菌丝体到原基转变的分子机制,目前仍不清楚.现有的研究大多集中在有限的真菌种类或环境因素上,但对在发育中起关键作用的基因提供的信息有限.[目的]研究大型真菌原基形成的分子机制.[方法]对11个物种及4个环境因子相关的转录组数据进行分析.[结果]与对照组相比,上调基因数量从白灵菇(Pleurotus tuoliensis)的325个到梅里克氏菌(Rickenella mellea)的2854个,下调基因数量从白灵菇的379个到圆环蜜环菌(Armillaria ostoyae)的3189个.根据gene ontology (GO)注释,前3个生物过程类别为氧化-还原过程、代谢过程和碳水化合物代谢过程.此外,细胞成分类别中膜整体成分、核、膜等显著富集.同样地,分子功能类别包括水解酶活性、氧化还原酶活性和催化活性.[结论]大型真菌在原基形成中存在可能发挥重要作用的共同通路.

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