一株类猪圆环病毒2型因子P1的全基因组序列测定与分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 温立斌
作者: 温立斌;何孔旺;杨汉春
作者机构:
关键词: 猪圆环病毒2型;P1;全基因组;序列测定与分析
期刊名称: 中国农业科学
ISSN: 0578-1752
年卷期: 2010 年 43 卷 02 期
页码: 411-416
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】确定猪体内存在与猪圆环病毒2型核苷酸序列高度同源的因子。【方法】首先利用PCR方法对来自临床表现为猪断奶后多系统衰竭综合征的猪血清所抽提的DNA进行扩增,根据获得的序列再设计引物进行反向PCR,拼接得到类猪圆环病毒2型因子P1的全基因组序列,最后根据P1全基因组序列设计引物扩增其全基因组加以验证。【结果】首次完成了类猪圆环病毒2型因子P1的全基因组序列测定。测序结果表明P1因子为环状DNA基因组,全长648个核苷酸,包括3个开放阅读框。除5′端16个核苷酸外,P1因子与国内猪圆环病毒2型BF毒株的核苷酸同源率为98.42%。系统进化分析表明P1与猪圆环病毒有很近的亲缘关系。【结论】猪体内存在类猪圆环病毒2型因子P1。
分类号: S852.65
- 相关文献
[1]TUNEL法检测类猪圆环病毒2型因子P1诱导猪免疫器官细胞凋亡的研究. 温立斌,何孔旺,杨汉春,王玉然,董美响. 2008
[2]猪圆环病毒2型滨州分离株全基因组的克隆与序列分析. 张文通,李峰,魏凤,苗立中,吴家强,沈志强. 2015
[3]猪圆环病毒2型吉林分离株全基因组的克隆与序列分析. 杨博超,王凤雪,温永俊,李建喜,杨志强,武华. 2013
[4]猪圆环病毒2型山西分离株的遗传变异多样性分析. 吴忻,孟帆,姚敬明,樊振华,王娟萍,韩一超,米瑞娟,薛翼鹏,赵岳,刘文俊. 2017
[5]猪圆环病毒2型山西株全基因组序列分析. 孟帆,吴忻,姚敬明,樊振华,刘文俊,王娟萍,韩一超,薛翼鹏,米瑞娟,李玉斌. 2016
[6]猪圆环病毒2型的分离鉴定及其全基因组序列分析. 汪磊,赵宝磊,冯华,刘运超,魏蔷,张改平. 2018
[7]PCV2海南株全基因组的克隆与序列分析. 曹宗喜,郑心力,张艳,叶保国,林哲敏,王峰. 2015
[8]猪圆环病毒2型山东分离株全基因组的克隆与序列分析. 柳美玲,秦晓冰,王爱华,牛晋国,单虎. 2008
[9]4株H3N2亚型猪源流感病毒HA基因的序列测定与特性分析. 李敏,向华,宣华. 2009
[10]鸭Ⅰ型禽副粘病毒YH_(99)V株HN基因的克隆和序列分析. 云涛,何永强,刘光清,梁华丽,倪征,华炯钢,李双茂. 2006
[11]鸡马立克氏病病毒LMS分离株基因组重复区的测定及分析. 成云,张艳萍,李志杰,郑永胜,谭成章,刘长军. 2012
[12]1株H12N7亚型禽流感病毒全基因组测定及遗传演化分析. 谭丹,崔鹏飞,黄建龙,王昌建,李文辉,范仲鑫,张芳,何世成,唐小明. 2014
[13]猪圆环病毒2型分离株的基因组克隆、序列测定与分析. 全滟平,崔尚金,宋木霞,姜艳玲. 2006
[14]类圆环病毒因子P1感染对猪外周血单个核细胞抗病毒蛋白mRNA转录的影响. 温立斌,何孔旺,杨汉春,郭容利,俞正玉,茅爱华,倪艳秀,张雪寒,周俊明,吕立新,李彬,王小敏. 2010
[15]类圆环病毒因子P1结构蛋白表位肽抗体的制备及应用. 温立斌,何孔旺,杨汉春,刘梦雅. 2011
[16]类猪圆环病毒因子P1 VP2蛋白二级结构与B细胞表位预测. 温立斌,何孔旺,杨汉春,王玉然. 2009
[17]从蛋白质和转录水平鉴定类猪圆环病毒P1存在ORF2和ORF3. 王凤芝,温立斌,姚火春,何孔旺. 2014
[18]类圆环病毒P1 VP1蛋白单克隆抗体的制备及应用. 王凤芝,温立斌,姚火春,何孔旺. 2014
[19]SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR检测类猪圆环病毒因子P1. 温立斌,何孔旺,杨汉春,郭容利,周俊明,钟书霖. 2009
[20]微生物全基因组范围内的最小基因组研究进展. 刘晓艳,闵勇,张薇,王开梅,万中义,江爱兵,张光阳,程贤亮,杨自文. 2013
作者其他论文 更多>>
-
猪圆环病毒2型ORF1部分位点突变对病毒复制能力的影响
作者:李荷然;肖琦;温立斌;朱雪蛟;芮荣;何孔旺
关键词:猪圆环病毒2型;Rep蛋白;病毒复制
-
藏猪猪链球菌的分离鉴定及其致病性和药物敏感性分析
作者:赵霞玲;肖琦;钱雯娴;倪艳秀;祝昊丹;周俊明;汪伟;温立斌;温东旭;严明帅;牛家强;何孔旺
关键词:藏猪;分离鉴定;血清型;致病性;药敏试验
-
多重荧光定量PCR检测猪圆环病毒2a、2b和2d基因型方法的建立与应用
作者:钱雯娴;肖琦;赵霞玲;温立斌;索朗斯珠;何孔旺
关键词:猪圆环病毒2型;多重荧光定量PCR;检测;基因型
-
非洲猪瘟病毒P30蛋白单克隆抗体制备、鉴定及阻断ELISA方法的建立
作者:张冯禧;肖琦;朱家平;尹力鸿;赵霞玲;严明帅;徐晋花;温立斌;牛家强;何孔旺
关键词:非洲猪瘟病毒;P30蛋白;单克隆抗体;抗原表位;阻断ELISA
-
猪圆环病毒2型和3型双重PCR方法的建立及在藏猪猪圆环病毒检测中的应用
作者:朱家平;肖琦;钱雯娴;赵霞玲;张冯禧;尹力鸿;温立斌;索朗斯珠;何孔旺
关键词:猪圆环病毒2型;猪圆环病毒3型;双重PCR方法;藏猪;临床应用
-
猪链球菌4型GalR蛋白的生物信息学分析及原核表达
作者:孙珂;祝昊丹;周俊明;王丹丹;俞正玉;吕立新;何孔旺;李彬;倪艳秀
关键词:猪链球菌4型(SS4);转录调控因子GalR;生物信息学;原核表达
-
次氯酸消毒液对猪源病原体的消杀效果
作者:肖琦;赵霞玲;钱雯娴;朱家平;张冯禧;尹力鸿;温立斌;何孔旺
关键词:次氯酸;猪;细菌;病毒;消毒