甘薯多酚氧化酶cDNA的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 彭世清

作者： 彭世清;陈守才

作者机构：

关键词： 甘薯;多酚氧化酶;cDNA;序列分析;同源性分析

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1006-1304

年卷期： 2002 年 10 卷 03 期

页码： 241-245

收录情况： CSCD

摘要： 植物多酚氧化酶(polyphenoloxidase,PPO)是一类核编码的铜金属酶,含有2个保守的铜结合区域(CuA和CuB),N端和C端部分缺乏明显的同源性。根据植物PPO的结构特点,从2个保守的铜结合区域的氨基酸序列设计一对简并引物,扩增了甘薯(IpomoeabatatasL.)PPO保守区之间的cDNA片段,测序表明该片段含595bp,编码195个氨基酸,推导的氨基酸序列包含了植物PPO的2个保守的铜结合区域,与葡萄(Vitisvinifera )、番茄(Lycopersiconesculentum)、马铃薯(Solanumtuberosum)和蚕豆(Viciafaba )PPO保守区的同源性分别为71.3%、80.8%、79.8%、70.6%。在此基础上设计引物通过3'RACE和5'RACE的方法获得了甘薯PPOcDNA的3'端和5'端的片段。最后根据保守区的cDNA片段、3'RACE片段和5'RACE片段的序列信息进行拼接,推导出甘薯PPOcDNA的全部序列信息。结果表明:甘薯PPOcDNA全长含1984bp,有完整的阅读框,编码588个氨基酸。另外5'非翻译区16bp,3'非翻译区202bp,其中包括1个多聚腺苷酸化信号AATAAA,以及1个含17个腺苷酸的ploy(A)尾。由甘薯PPOcDNA推导的氨基酸序列与由葡萄、番茄、马铃薯和蚕豆PPOcDNA推导的氨基酸序列进行比较,它们之间存在较明显的同源性,同源性分别为49%、48%、47%和49%。

分类号： S531

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